RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478910.5

DLGAP4-208, Transcript of DLG associated protein 4, human

TSL 2

Gene DLGAP4, Length 2,674 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DLGAP4-208	ENST00000478910	CCDC88C	Q9P219	2028 aa		13.55	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910		A0A0A6YYD5	115 aa		13.55	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	TRBC2	A0A5B9	178 aa		13.55	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	ERI3	O43414	337 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	CLEC3A	O75596	197 aa		13.55	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	FH	P07954	510 aa		13.55	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	ALPPL2	P10696	532 aa		13.55	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	DNAJA1	P31689	397 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	SLC19A1	P41440	591 aa		13.55	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	RPL35	P42766	123 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	RAB8A	P61006	207 aa		13.55	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	HEPACAM	Q14CZ8	416 aa		13.55	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	TEAD4	Q15561	434 aa		13.55	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	TRIM40	Q6P9F5	258 aa		13.55	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	SLC37A3	Q8NCC5	494 aa		13.55	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	OR52J3	Q8NH60	311 aa		13.55	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	LCN9	Q8WX39	176 aa		13.55	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	PATE1	Q8WXA2	126 aa		13.55	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	DDX31	Q9H8H2	851 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	FBRS	Q9HAH7	460 aa		13.55	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	NDUFAF4	Q9P032	175 aa		13.55	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		13.55	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	CMAHP	Q9Y471	501 aa		13.55	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	FKBP7	Q9Y680	259 aa		13.55	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910		J3KTA2	159 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	SULT1B1	O43704	296 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	PRAMEF10	O60809	474 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	FPR1	P21462	350 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	UQCRC2	P22695	453 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	MAP2K3	P46734	347 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	ITGA1	P56199	1179 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	PCBP4	P57723	403 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	PSPH	P78330	225 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	GPR68	Q15743	365 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	LCN1P1	Q5VSP4	162 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	CEACAM20	Q6UY09	585 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	PHF21A	Q96BD5	680 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	MS4A6E	Q96DS6	147 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	OTUB1	Q96FW1	271 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	WDR92	Q96MX6	357 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	WDFY2	Q96P53	400 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	NLN	Q9BYT8	704 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	REEP1	Q9H902	201 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	C2orf42	Q9NWW7	574 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	HPF1	Q9NWY4	346 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	GLS2	Q9UI32	602 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	RAB23	Q9ULC3	237 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	NIN	Q8N4C6	2090 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	PGRMC2	O15173	223 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	FABP7	O15540	132 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	PROM1	O43490	865 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	PCDHGA12	O60330	932 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	CDK1	P06493	297 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	LIMK1	P53667	647 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	FGFBP1	Q14512	234 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	ZIC1	Q15915	447 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	PYDC2	Q56P42	97 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	ZNF542P	Q5EBM4	170 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	OLIG3	Q7RTU3	272 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	STX19	Q8N4C7	294 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	COL21A1	Q96P44	957 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	TCEAL2	Q9H3H9	227 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	TMEM38A	Q9H6F2	299 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	ATG4B	Q9Y4P1	393 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	CLCA3P	Q9Y6N3	262 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	COL4A2	P08572	1712 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	HNRNPCL2	B2RXH8	293 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	HNRNPA2B1	P22626	353 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	KIAA1024L	P59773	190 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	DUSP2	Q05923	314 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	CCIN	Q13939	588 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	ZNF704	Q6ZNC4	412 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	SZRD1	Q7Z422	152 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	OR5P2	Q8WZ92	322 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	TBC1D20	Q96BZ9	403 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	QRFPR	Q96P65	431 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	CNPPD1	Q9BV87	410 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	RAB11FIP5	Q9BXF6	653 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	C6orf106	Q9H6K1	298 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	PRDM7	Q9NQW5	492 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	APOBEC3B	Q9UH17	382 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	FBXW2	Q9UKT8	454 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	CACNG2	Q9Y698	323 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910		A0A0B4J203	849 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DLGAP4-208	ENST00000478910	KHNYN	O15037	678 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.3 ms