RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473722.5

SCIN-205, Transcript of scinderin, human

TSL 4

Gene SCIN, Length 656 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SCIN-205	ENST00000473722	GAGE6	Q13070	117 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	RPA4	Q13156	261 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	PTPRCAP	Q14761	206 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	WSCD2	Q2TBF2	565 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	TTMP	Q5BVD1	217 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	PLEKHS1	Q5SXH7	462 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	TMEM198	Q66K66	360 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	SEL1L3	Q68CR1	1132 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	KCTD16	Q68DU8	428 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	CNST	Q6PJW8	725 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	KDM7A	Q6ZMT4	941 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722		Q75L30	129 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	LPCAT2	Q7L5N7	544 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	PARG	Q86W56	976 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	TRAPPC5	Q8IUR0	188 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	SLC22A9	Q8IVM8	553 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	PIANP	Q8IYJ0	282 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	RAB42	Q8N4Z0	105 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	BANP	Q8N9N5	519 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	AVL9	Q8NBF6	648 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	RHEBL1	Q8TAI7	183 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	RAB3IL1	Q8TBN0	382 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	LRRC8C	Q8TDW0	803 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	PDLIM5	Q96HC4	596 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	PGAM5	Q96HS1	289 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	COX14	Q96I36	57 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	SERAC1	Q96JX3	654 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	FOPNL	Q96NB1	174 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	BIRC8	Q96P09	236 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	SMIM14	Q96QK8	99 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	MRPL57	Q9BQC6	102 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	SELENOS	Q9BQE4	189 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	TIMM29	Q9BSF4	260 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	GPR174	Q9BXC1	333 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	DERL2	Q9GZP9	239 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	DPEP2	Q9H4A9	486 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	FAF1	Q9UNN5	650 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	SLC17A4	Q9Y2C5	497 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	DHRS7	Q9Y394	339 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	SCN8A	Q9UQD0	1980 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	C10orf142	B7Z368	130 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722		H3BQF6	201 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	PLK4	O00444	970 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	CHUK	O15111	745 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	KMO	O15229	486 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	INPP4B	O15327	924 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	SYNGR3	O43761	229 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	OR1I1	O60431	355 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	UGT1A9	O60656	530 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	KERA	O60938	352 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	SMIM24	O75264	130 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	WISP3	O95389	354 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	PAK4	O96013	591 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	SP1	P08047	785 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	TPBGL	P0DKB5	382 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	MPC1L	P0DKB6	136 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	GABRB1	P18505	474 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	UGT1A6	P19224	532 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	CYP2A7	P20853	494 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	SAT1	P21673	171 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	UGT1A4	P22310	534 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	HRH2	P25021	359 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	MAT2A	P31153	395 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	UGT1A3	P35503	534 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	UGT1A5	P35504	534 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	AHR	P35869	848 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	CSRP3	P50461	194 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	CTSC	P53634	463 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	AP1S2	P56377	157 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	TAS2R39	P59534	338 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	PFN3	P60673	137 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	IL9R	Q01113	521 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	SEMG2	Q02383	582 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	DMPK	Q09013	629 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	CDKL4	Q5MAI5	379 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	HHAT	Q5VTY9	493 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	TTC23L	Q6PF05	361 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	FRA10AC1	Q70Z53	315 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	CMC1	Q7Z7K0	106 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	LDB1	Q86U70	411 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	AMZ2	Q86W34	360 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	C4orf33	Q8N1A6	199 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	TCAIM	Q8N3R3	496 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	CCDC63	Q8NA47	563 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	OR2L2	Q8NH16	312 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SCIN-205	ENST00000473722	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		4.81	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.2 ms