RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472326.2

SGCE-210, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 2

Gene SGCE, Length 453 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-210ENST00000472326 RPA1P27694 616 aa4.52□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 NUMBP49757 651 aa4.52□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 AP1B1Q10567 949 aa4.52□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 SPATA46Q5T0L3 261 aa4.52□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 OR6B2Q6IFH4 312 aa4.52□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 IGFL2Q6UWQ7 119 aa4.52□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 TMEM26Q6ZUK4 368 aa4.52□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 ARNTL2Q8WYA1 636 aa4.52□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 PSMG2Q969U7 264 aa4.52□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 MARC2Q969Z3 335 aa4.52□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 PLEKHF1Q96S99 279 aa4.52□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 EHD1Q9H4M9 534 aa4.52□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 NUDCQ9Y266 331 aa4.52□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 L3MBTL1Q9Y468 752 aa4.52□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa4.51□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 E9PLD3 99 aa4.51□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 ALOX15BO15296 676 aa4.51□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 IGLV1-47P01700 117 aa4.51□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 SLC26A2P50443 739 aa4.51□□□□□ -1.69
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SGCE-210ENST00000472326 KCNJ11Q14654 390 aa4.51□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 HERPUD1Q15011 391 aa4.51□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 OTPQ5XKR4 325 aa4.51□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 Q7L0L9 218 aa4.51□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa4.51□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 ADIPOR1Q96A54 375 aa4.51□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 CCSER1Q9C0I3 900 aa4.51□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 THAP9Q9H5L6 903 aa4.51□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 ZNF221Q9UK13 617 aa4.51□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 SAGE2PA6NJ88 616 aa4.5□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 CASKO14936 926 aa4.5□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 RAMP1O60894 148 aa4.5□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 SFNP31947 248 aa4.5□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 RBMXP38159 391 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 KRTAP10-8P60410 259 aa4.5□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 PSG7Q13046 419 aa4.5□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 PPP2R5CQ13362 524 aa4.5□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 RABEPKQ7Z6M1 372 aa4.5□□□□□ -1.69
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SGCE-210ENST00000472326 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 CFAP73A6NFT4 308 aa4.49□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 ARHGAP42A6NI28 874 aa4.49□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa4.49□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 SCRG1O75711 98 aa4.49□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 ANP32DO95626 131 aa4.49□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 FUT3P21217 361 aa4.49□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 PTPN6P29350 595 aa4.49□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 LIM2P55344 173 aa4.49□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 KARSQ15046 597 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
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SGCE-210ENST00000472326 CXCL17Q6UXB2 119 aa4.49□□□□□ -1.69
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SGCE-210ENST00000472326 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa4.49□□□□□ -1.69
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SGCE-210ENST00000472326 TFDP1Q14186 410 aa4.48□□□□□ -1.69
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SGCE-210ENST00000472326 CCDC40Q4G0X9 1142 aa4.48□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 TEX44Q53QW1 395 aa4.48□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 OR2B11Q5JQS5 317 aa4.48□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 MIER3Q7Z3K6 550 aa4.48□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 ELSPBP1Q96BH3 223 aa4.48□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 ZNF799Q96GE5 643 aa4.48□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 TMEM231Q9H6L2 316 aa4.48□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 PTGES2Q9H7Z7 377 aa4.48□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 P2RX2Q9UBL9 471 aa4.48□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 PPIAL4AQ9Y536 164 aa4.48□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.48□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 CECR2Q9BXF3 1484 aa4.48□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 LRRK1Q38SD2 2015 aa4.47□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 DHRS7CA6NNS2 312 aa4.47□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 NDUFA7O95182 113 aa4.47□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 CD55P08174 381 aa4.47□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 GSTT2P0CG29 244 aa4.47□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 GSTT2BP0CG30 244 aa4.47□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 RALAP11233 206 aa4.47□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 KRTAP5-9P26371 169 aa4.47□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 RPL4P36578 427 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 CAV2P51636 162 aa4.47□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 ZNF154Q13106 437 aa4.47□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 SNX1Q13596 522 aa4.47□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 IL17AQ16552 155 aa4.47□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 TMEM52BQ4KMG9 183 aa4.47□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 SLC10A5Q5PT55 438 aa4.47□□□□□ -1.69
SGCE-210ENST00000472326 OR5M10Q6IEU7 315 aa4.47□□□□□ -1.69
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