RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 DECR1Q16698 335 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 DEFB110Q30KQ9 67 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF311Q5JNZ3 666 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 DCST1Q5T197 706 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM236Q5W0B7 351 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 NIPAL1Q6NVV3 410 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 KLHL35Q6PF15 583 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 NPSR1Q6W5P4 371 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 SLC36A4Q6YBV0 504 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 DEF8Q6ZN54 512 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 LINC00299Q6ZSB3 139 aa5.25□□□□□ -1.57
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PTPRC-210ENST00000462363 ZAR1Q86SH2 424 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 GKN2Q86XP6 184 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF595Q8IYB9 648 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 SIX5Q8N196 739 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 DEPDC4Q8N2C3 294 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 SLC25A45Q8N413 288 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
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PTPRC-210ENST00000462363 ZNF615Q8N8J6 731 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 CDRT4Q8N9R6 151 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 OR8D4Q8NGM9 314 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 OR52P1PQ8NH57 321 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 LMX1AQ8TE12 382 aa5.25□□□□□ -1.57
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PTPRC-210ENST00000462363 SLC41A2Q96JW4 573 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 HSPA12BQ96MM6 686 aa5.25□□□□□ -1.57
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PTPRC-210ENST00000462363 IER2Q9BTL4 223 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF426Q9BUY5 554 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 TAPBPLQ9BX59 468 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
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PTPRC-210ENST00000462363 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 EVA1AQ9H8M9 152 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 SLC24A3Q9HC58 644 aa5.25□□□□□ -1.57
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PTPRC-210ENST00000462363 RASSF1Q9NS23 344 aa5.25□□□□□ -1.57
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PTPRC-210ENST00000462363 STARD5Q9NSY2 213 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 SCN3BQ9NY72 215 aa5.25□□□□□ -1.57
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PTPRC-210ENST00000462363 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
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PTPRC-210ENST00000462363 U3KQA8 63 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 UNC13CQ8NB66 2214 aa5.25□□□□□ -1.57
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PTPRC-210ENST00000462363 H0YIG0 161 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 I3L1I5 382 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 HRKO00198 91 aa5.24□□□□□ -1.57
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PTPRC-210ENST00000462363 ADAM11O75078 769 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 CYP7B1O75881 506 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 LCKP06239 509 aa5.24□□□□□ -1.57
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PTPRC-210ENST00000462363 PRG2P13727 222 aa5.24□□□□□ -1.57
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PTPRC-210ENST00000462363 DRD5P21918 477 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 CDH3P22223 829 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
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PTPRC-210ENST00000462363 LIPAP38571 399 aa5.24□□□□□ -1.57
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PTPRC-210ENST00000462363 UGT2B15P54855 530 aa5.24□□□□□ -1.57
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PTPRC-210ENST00000462363 HSD17B7P56937 341 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 FXYD6P3P58550 94 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 TSPAN31Q12999 210 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 FHL1Q13642 323 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
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