RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454716.1

RPS3AP53-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 53, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP53, Length 778 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP53-201ENST00000454716 FAM96AQ9H5X1 160 aa4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 ASB8Q9H765 288 aa4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 COG4Q9H9E3 785 aa4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 ZNF160Q9HCG1 818 aa4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 C20orf141Q9NUB4 165 aa4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 CTSFQ9UBX1 484 aa4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 FAM153AQ9UHL3 310 aa4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 PLAGL1Q9UM63 463 aa4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 PLCL2Q9UPR0 1127 aa4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 KLHL20Q9Y2M5 609 aa4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 DOCK10Q96BY6 2186 aa4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 PCNX1Q96RV3 2341 aa4.77□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 A0A087X0T9 212 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 TRAV17A0A0B4J275 112 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 A0A0J9YY10 115 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 LRRD1A4D1F6 860 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 PMS2P5A8MQ11 134 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 CCL22O00626 93 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 STX7O15400 261 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 SRP72O76094 671 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 AGTP01019 485 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 EPOP01588 193 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 TUBBP07437 444 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 CYC1P08574 325 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 FAM228BP0C875 321 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 PRSS56P0CW18 603 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 TPBGLP0DKB5 382 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 ITGA2P17301 1181 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 CAPN3P20807 821 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 OR1D4P47884 311 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 TNFSF10P50591 281 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 XIAPP98170 497 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 TLE4Q04727 773 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 WASHC5Q12768 1159 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 OLIG2Q13516 323 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 PDK1Q15118 436 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 RBBP7Q16576 425 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 C3AR1Q16581 482 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 NUP210LQ5VU65 1888 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 XKRXQ6PP77 449 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 SLC22A25Q6T423 547 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 PRSS58Q8IYP2 241 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 IPMKQ8NFU5 416 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 OR4K2Q8NGD2 314 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 OR10V1Q8NGI7 309 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 OR13C4Q8NGS5 318 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 PSMF1Q92530 271 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 C14orf79Q96F83 325 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 DCUN1D1Q96GG9 259 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 FAM110AQ9BQ89 295 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 WDR54Q9H977 334 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 ANO10Q9NW15 660 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 EURLQ9NYK6 297 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 HACD3Q9P035 362 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 ABI3Q9P2A4 366 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 SEC14L3Q9UDX4 400 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 MAU2Q9Y6X3 613 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 FBN3Q75N90 2809 aa4.76□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 NAV3Q8IVL0 2385 aa4.75□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa4.75□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 A0A1B0GX78 115 aa4.75□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 VSTM2BA6NLU5 285 aa4.75□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 C2orf81A6NN90 581 aa4.75□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 AGAP14A8MT82 685 aa4.75□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 ZNF487B1APH4 448 aa4.75□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 ZNHIT1O43257 154 aa4.75□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 SLC19A2O60779 497 aa4.75□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 NADKO95544 446 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 WDPCPO95876 746 aa4.75□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 HPP00738 406 aa4.75□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 COX6A1P12074 109 aa4.75□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 COX7A2P14406 83 aa4.75□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 MAGP20916 626 aa4.75□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 SHMT2P34897 504 aa4.75□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 CD151P48509 253 aa4.75□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 KLC1Q07866 573 aa4.75□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 INAQ16352 499 aa4.75□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 SLC5A12Q1EHB4 618 aa4.75□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 TMEM35AQ53FP2 167 aa4.75□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 FAAH2Q6GMR7 532 aa4.75□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 CEP97Q8IW35 865 aa4.75□□□□□ -1.65
RPS3AP53-201ENST00000454716 ZNF567Q8N184 647 aa4.75□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms