RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429895.5

PTPRF-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRF, Length 6,312 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-206ENST00000429895 OR5M10Q6IEU7 315 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 SOBPA7XYQ1 873 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 DBHP09172 617 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 FKBP10Q96AY3 582 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 PCTPQ9UKL6 214 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 LMO7Q8WWI1 1683 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 MEIS3P1A6NDR6 274 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 EDN3P14138 238 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 HTR2AP28223 471 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 CAV2P51636 162 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 CTC1Q2NKJ3 1217 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 C22orf15Q8WYQ4 148 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 TBCCD1Q9NVR7 557 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 TMEM9Q9P0T7 183 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 ZNF623O75123 536 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 GGT1P19440 569 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 CDK2P24941 298 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 AQP2P41181 271 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 GTDC1Q4AE62 458 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 KLHL13Q9P2N7 655 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 SPO11Q9Y5K1 396 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 PHLPP1O60346 1717 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 C2orf72A6NCS6 295 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 ABOP16442 354 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 TNFSF4P23510 183 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 BORCS7Q96B45 105 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 SYT3Q9BQG1 590 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 OR6C6A6NF89 314 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 LILRB5O75023 590 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 RGS6P49758 472 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 TMBIM6P55061 237 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 RAB15P59190 212 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 SERTAD2Q14140 314 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 ERV3-1Q14264 604 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 VHLLQ6RSH7 139 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 OR1S1Q8NH92 325 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 ARL5BQ96KC2 179 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 PHB2Q99623 299 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 DYNLRB1Q9NP97 96 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 CDC14CA4D256 554 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 DRD5P21918 477 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 STT3AP46977 705 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 DAP3P51398 398 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 ZNF33BQ06732 778 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 RGNQ15493 299 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 ZNF181Q2M3W8 571 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 VRTNQ9H8Y1 702 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 GCM1Q9NP62 436 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 PLEK2Q9NYT0 353 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 LRFN1Q9P244 771 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 UBL4AP11441 157 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 XCR1P46094 333 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 PCGF3Q3KNV8 242 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 CDS1Q92903 461 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 LGALS12Q96DT0 336 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 MED16Q9Y2X0 877 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 TIMP2P16035 220 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 FGL1Q08830 312 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 BCL2A1Q16548 175 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 LRRTM3Q86VH5 581 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 OR52R1Q8NGF1 315 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 IL1F10Q8WWZ1 152 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 SLC12A9Q9BXP2 914 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 SLC25A18Q9H1K4 315 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 MAGIXQ9H6Y5 334 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 PISDQ9UG56 409 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 SCML1Q9UN30 329 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 PTGESO14684 152 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 WDPCPO95876 746 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 GABRA2P47869 451 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 OR9A4Q8NGU2 314 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 PLSCR5A0PG75 271 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 ANKRD34BA5PLL1 514 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 ADAMTS4O75173 837 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 LPLP06858 475 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 TMEM150AQ86TG1 271 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 OR52E1Q8NGJ3 308 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 CA5BQ9Y2D0 317 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 UBR1Q8IWV7 1749 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 NDUFB2O95178 105 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 FUT1P19526 365 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
PTPRF-206ENST00000429895 PSMB10P40306 273 aa14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 129.7 ms