RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425989.5

HDLBP-211, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-211ENST00000425989 GADD45GO95257 159 aa8.9□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 IL33O95760 270 aa8.9□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 DLGAP3O95886 979 aa8.9□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 NGFRP08138 427 aa8.9□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 IFNGR2P38484 337 aa8.9□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 FOLR3P41439 243 aa8.9□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 CLK3P49761 638 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 ST3GAL3Q11203 375 aa8.9□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 DAG1Q14118 895 aa8.9□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 EFR3AQ14156 821 aa8.9□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP8.9□□□□□ -0.983e-11■■■□□ 19.1
HDLBP-211ENST00000425989 NCF4Q15080 339 aa8.9□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 GPR68Q15743 365 aa8.9□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 NRF1Q16656 503 aa8.9□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 FLYWCH1Q4VC44 716 aa8.9□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 HES3Q5TGS1 186 aa8.9□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 TTC23Q5W5X9 447 aa8.9□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 TCTN3Q6NUS6 607 aa8.9□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 IGF2-ASQ6U949 168 aa8.9□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF550Q7Z398 422 aa8.9□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 STK32CQ86UX6 486 aa8.9□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 TAGAPQ8N103 731 aa8.9□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 CBR4Q8N4T8 237 aa8.9□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 DHRSXQ8N5I4 330 aa8.9□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 GPR32P1Q8NGA4 272 aa8.9□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 GIPC3Q8TF64 312 aa8.9□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 TSLPQ969D9 159 aa8.9□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 DHRS1Q96LJ7 313 aa8.9□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 ARHGDIGQ99819 225 aa8.9□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 FNDC11Q9BVV2 318 aa8.9□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 NUDT9Q9BW91 350 aa8.9□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa8.9□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 ANKRA2Q9H9E1 313 aa8.9□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 CTSFQ9UBX1 484 aa8.9□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 KCND3Q9UK17 655 aa8.9□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 ACAD8Q9UKU7 415 aa8.9□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 MKLN1Q9UL63 735 aa8.9□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa8.9□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 DNAH14Q0VDD8 3507 aa8.9□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 A0A1W2PQD3 144 aa8.89□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 A0A1W2PRQ8 180 aa8.89□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 OR2W5A6NFC9 320 aa8.89□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 A8MUA0 341 aa8.89□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 hCG_2039718K7EN88 272 aa8.89□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 TM4SF5O14894 197 aa8.89□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 GDF9O60383 454 aa8.89□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 UGT2B11O75310 529 aa8.89□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 OPN1SWP03999 348 aa8.89□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 CLPSP04118 112 aa8.89□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 ALPLP05186 524 aa8.89□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 HPGDP15428 266 aa8.89□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 TCN2P20062 427 aa8.89□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 TBXA2RP21731 343 aa8.89□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 MMP11P24347 488 aa8.89□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 PTGER1P34995 402 aa8.89□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 RNF4P78317 190 aa8.89□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 COX10Q12887 443 aa8.89□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 DGCR6Q14129 220 aa8.89□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 MICAQ29983 383 aa8.89□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 CCDC157Q569K6 752 aa8.89□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 DCST1Q5T197 706 aa8.89□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 DHRS13Q6UX07 377 aa8.89□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 NDUFAF7Q7L592 441 aa8.89□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 NUP54Q7Z3B4 507 aa8.89□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF605Q86T29 641 aa8.89□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 SLCO6A1Q86UG4 719 aa8.89□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 SLC34A3Q8N130 599 aa8.89□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 GALNT4Q8N4A0 578 aa8.89□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 BCORP1Q8N888 145 aa8.89□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 GALNT6Q8NCL4 622 aa8.89□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 SIMC1Q8NDZ2 872 aa8.89□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 PIK3R3Q92569 461 aa8.89□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 DIO2Q92813 273 aa8.89□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 PRRC1Q96M27 445 aa8.89□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 SLC29A1Q99808 456 aa8.89□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF559Q9BR84 538 aa8.89□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF700Q9H0M5 742 aa8.89□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF556Q9HAH1 456 aa8.89□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 ACER3Q9NUN7 267 aa8.89□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 PISDQ9UG56 409 aa8.89□□□□□ -0.99
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.1 ms