RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425695.5

HTATSF1-202, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene HTATSF1, Length 885 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-202ENST00000425695 STX5Q13190 355 aa22.79■■□□□ 1.24
HTATSF1-202ENST00000425695 SPANXN4Q5MJ08 99 aa22.79■■□□□ 1.24
HTATSF1-202ENST00000425695 WLSQ5T9L3 541 aa22.79■■□□□ 1.24
HTATSF1-202ENST00000425695 EID3Q8N140 333 aa22.79■■□□□ 1.24
HTATSF1-202ENST00000425695 COX18Q8N8Q8 333 aa22.79■■□□□ 1.24
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
HTATSF1-202ENST00000425695 OR4A15Q8NGL6 344 aa22.79■■□□□ 1.24
HTATSF1-202ENST00000425695 RNF138Q8WVD3 245 aa22.79■■□□□ 1.24
HTATSF1-202ENST00000425695 OR52B2Q96RD2 323 aa22.79■■□□□ 1.24
HTATSF1-202ENST00000425695 NEUROD4Q9HD90 331 aa22.79■■□□□ 1.24
HTATSF1-202ENST00000425695 FBXO34Q9NWN3 711 aa22.79■■□□□ 1.24
HTATSF1-202ENST00000425695 FBXL2Q9UKC9 423 aa22.79■■□□□ 1.24
HTATSF1-202ENST00000425695 PCDHGB4Q9UN71 923 aa22.79■■□□□ 1.24
HTATSF1-202ENST00000425695 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
HTATSF1-202ENST00000425695 GPR45Q9Y5Y3 372 aa22.79■■□□□ 1.24
HTATSF1-202ENST00000425695 USH1CQ9Y6N9 552 aa22.79■■□□□ 1.24
HTATSF1-202ENST00000425695 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
HTATSF1-202ENST00000425695 S100A3P33764 101 aa22.78■■□□□ 1.24
HTATSF1-202ENST00000425695 SMSP52788 366 aa22.78■■□□□ 1.24
HTATSF1-202ENST00000425695 DGKQP52824 942 aa22.78■■□□□ 1.24
HTATSF1-202ENST00000425695 GRAMD1BQ3KR37 738 aa22.78■■□□□ 1.24
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa22.78■■□□□ 1.24
HTATSF1-202ENST00000425695 CCNJQ5T5M9 372 aa22.78■■□□□ 1.24
HTATSF1-202ENST00000425695 ANXA8L1Q5VT79 327 aa22.78■■□□□ 1.24
HTATSF1-202ENST00000425695 RPTNQ6XPR3 784 aa22.78■■□□□ 1.24
HTATSF1-202ENST00000425695 MARCH3Q86UD3 253 aa22.78■■□□□ 1.24
HTATSF1-202ENST00000425695 MARVELD2Q8N4S9 558 aa22.78■■□□□ 1.24
HTATSF1-202ENST00000425695 SFXN5Q8TD22 340 aa22.78■■□□□ 1.24
HTATSF1-202ENST00000425695 ACTRT2Q8TDY3 377 aa22.78■■□□□ 1.24
HTATSF1-202ENST00000425695 CDS1Q92903 461 aa22.78■■□□□ 1.24
HTATSF1-202ENST00000425695 MED12Q93074 2177 aa22.78■■□□□ 1.24
HTATSF1-202ENST00000425695 TESCQ96BS2 214 aa22.78■■□□□ 1.24
HTATSF1-202ENST00000425695 C7orf26Q96N11 449 aa22.78■■□□□ 1.24
HTATSF1-202ENST00000425695 ACTRT3Q9BYD9 372 aa22.78■■□□□ 1.24
HTATSF1-202ENST00000425695 RTN4RQ9BZR6 473 aa22.78■■□□□ 1.24
HTATSF1-202ENST00000425695 GPATCH2Q9NW75 528 aa22.78■■□□□ 1.24
HTATSF1-202ENST00000425695 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa22.78■■□□□ 1.24
HTATSF1-202ENST00000425695 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa22.77■■□□□ 1.24
HTATSF1-202ENST00000425695 E9PBE3 544 aa22.77■■□□□ 1.24
HTATSF1-202ENST00000425695 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
HTATSF1-202ENST00000425695 KCNK2O95069 426 aa22.77■■□□□ 1.24
HTATSF1-202ENST00000425695 IL12AP29459 219 aa22.77■■□□□ 1.24
HTATSF1-202ENST00000425695 CLK3P49761 638 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
HTATSF1-202ENST00000425695 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
HTATSF1-202ENST00000425695 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
HTATSF1-202ENST00000425695 CDC73Q6P1J9 531 aa22.77■■□□□ 1.24
HTATSF1-202ENST00000425695 ZAR1Q86SH2 424 aa22.77■■□□□ 1.24
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
HTATSF1-202ENST00000425695 VPS37AQ8NEZ2 397 aa22.77■■□□□ 1.24
HTATSF1-202ENST00000425695 ADAMTS15Q8TE58 950 aa22.77■■□□□ 1.24
HTATSF1-202ENST00000425695 MOAP1Q96BY2 351 aa22.77■■□□□ 1.24
HTATSF1-202ENST00000425695 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
HTATSF1-202ENST00000425695 BTBD2Q9BX70 525 aa22.77■■□□□ 1.24
HTATSF1-202ENST00000425695 DSN1Q9H410 356 aa22.77■■□□□ 1.24
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
HTATSF1-202ENST00000425695 ABCG2Q9UNQ0 655 aa22.77■■□□□ 1.24
HTATSF1-202ENST00000425695 KCNE3Q9Y6H6 103 aa22.77■■□□□ 1.24
HTATSF1-202ENST00000425695 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.23
HTATSF1-202ENST00000425695 SCN2BO60939 215 aa22.76■■□□□ 1.23
HTATSF1-202ENST00000425695 ACVR2AP27037 513 aa22.76■■□□□ 1.23
HTATSF1-202ENST00000425695 RPS26P62854 115 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
HTATSF1-202ENST00000425695 PMPCAQ10713 525 aa22.76■■□□□ 1.23
HTATSF1-202ENST00000425695 C6orf120Q7Z4R8 191 aa22.76■■□□□ 1.23
HTATSF1-202ENST00000425695 OR4K17Q8NGC6 315 aa22.76■■□□□ 1.23
HTATSF1-202ENST00000425695 OR14L1PQ8NHC6 308 aa22.76■■□□□ 1.23
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM110BQ8TC76 370 aa22.76■■□□□ 1.23
HTATSF1-202ENST00000425695 DUSP19Q8WTR2 217 aa22.76■■□□□ 1.23
HTATSF1-202ENST00000425695 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
HTATSF1-202ENST00000425695 ZBTB18Q99592 522 aa22.76■■□□□ 1.23
HTATSF1-202ENST00000425695 TIMP4Q99727 224 aa22.76■■□□□ 1.23
HTATSF1-202ENST00000425695 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa22.76■■□□□ 1.23
HTATSF1-202ENST00000425695 PIGUQ9H490 435 aa22.76■■□□□ 1.23
HTATSF1-202ENST00000425695 SDHAF3Q9NRP4 125 aa22.76■■□□□ 1.23
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF446Q9NWS9 450 aa22.76■■□□□ 1.23
HTATSF1-202ENST00000425695 MED11Q9P086 117 aa22.76■■□□□ 1.23
HTATSF1-202ENST00000425695 PCNX3Q9H6A9 2034 aa22.75■■□□□ 1.23
HTATSF1-202ENST00000425695 FIGNL2A6NMB9 653 aa22.75■■□□□ 1.23
HTATSF1-202ENST00000425695 B4DXG7 233 aa22.75■■□□□ 1.23
HTATSF1-202ENST00000425695 CASP9P55211 416 aa22.75■■□□□ 1.23
HTATSF1-202ENST00000425695 DPY19L1Q2PZI1 675 aa22.75■■□□□ 1.23
HTATSF1-202ENST00000425695 TMEM211Q6ICI0 200 aa22.75■■□□□ 1.23
HTATSF1-202ENST00000425695 XKRXQ6PP77 449 aa22.75■■□□□ 1.23
HTATSF1-202ENST00000425695 EPGNQ6UW88 154 aa22.75■■□□□ 1.23
HTATSF1-202ENST00000425695 APOOLQ6UXV4 268 aa22.75■■□□□ 1.23
HTATSF1-202ENST00000425695 OR4C3Q8NH37 302 aa22.75■■□□□ 1.23
HTATSF1-202ENST00000425695 STACQ99469 402 aa22.75■■□□□ 1.23
HTATSF1-202ENST00000425695 ACBD3Q9H3P7 528 aa22.75■■□□□ 1.23
HTATSF1-202ENST00000425695 DUSP22Q9NRW4 184 aa22.75■■□□□ 1.23
HTATSF1-202ENST00000425695 DKKL1Q9UK85 242 aa22.75■■□□□ 1.23
HTATSF1-202ENST00000425695 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa22.74■■□□□ 1.23
HTATSF1-202ENST00000425695 UBDO15205 165 aa22.74■■□□□ 1.23
HTATSF1-202ENST00000425695 KRT16P08779 473 aa22.74■■□□□ 1.23
HTATSF1-202ENST00000425695 IDO1P14902 403 aa22.74■■□□□ 1.23
HTATSF1-202ENST00000425695 BMP7P18075 431 aa22.74■■□□□ 1.23
HTATSF1-202ENST00000425695 MATN1P21941 496 aa22.74■■□□□ 1.23
HTATSF1-202ENST00000425695 NUP107P57740 925 aa22.74■■□□□ 1.23
HTATSF1-202ENST00000425695 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
HTATSF1-202ENST00000425695 CDSNQ15517 529 aa22.74■■□□□ 1.23
HTATSF1-202ENST00000425695 RTL6Q6ICC9 239 aa22.74■■□□□ 1.23
HTATSF1-202ENST00000425695 BHLHB9Q6PI77 547 aa22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 114.2 ms