RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416605.6

HACE1-204, Transcript of HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HACE1, Length 4,729 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1-204ENST00000416605 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP16.09■□□□□ 0.17
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HACE1-204ENST00000416605 SLC19A1P41440 591 aa16.09■□□□□ 0.17
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HACE1-204ENST00000416605 F5H5P2 479 aa16.07■□□□□ 0.16
HACE1-204ENST00000416605 B3GALT4O96024 378 aa16.07■□□□□ 0.16
HACE1-204ENST00000416605 DLX5P56178 289 aa16.07■□□□□ 0.16
HACE1-204ENST00000416605 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
HACE1-204ENST00000416605 HBMQ6B0K9 141 aa16.07■□□□□ 0.16
HACE1-204ENST00000416605 FIGNL1Q6PIW4 674 aa16.07■□□□□ 0.16
HACE1-204ENST00000416605 OR2L2Q8NH16 312 aa16.07■□□□□ 0.16
HACE1-204ENST00000416605 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
HACE1-204ENST00000416605 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
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