RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405655.7

PRAME-205, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRAME, Length 2,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-205ENST00000405655 ACSM5Q6NUN0 579 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 BORAQ6PGQ7 559 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 DIO2Q92813 273 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 ZDHHC12Q96GR4 267 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 PRRC1Q96M27 445 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 ZNF285Q96NJ3 590 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 UCK1Q9HA47 277 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 FOLH1BQ9HBA9 442 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 CUTCQ9NTM9 273 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 NDUFA13Q9P0J0 144 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 LIPT1Q9Y234 373 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 AGAP5A6NIR3 686 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 ZAR1LA6NP61 321 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 ZNF749O43361 778 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 SEC14L2O76054 403 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 NSA2O95478 260 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 CCNYL3P0C7X3 344 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 MAP3K8P41279 467 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 ZXDAP98168 799 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 LSAMPQ13449 338 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 HLA-BQ31612 363 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 PDZK1Q5T2W1 519 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 FAAH2Q6GMR7 532 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 GDF7Q7Z4P5 450 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 RASSF5Q8WWW0 418 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 ZNF350Q9GZX5 532 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 SLC13A4Q9UKG4 626 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 U3KQA8 63 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 DUXAA6NLW8 204 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 FAAHO00519 579 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 SIGLEC6O43699 453 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 CTNSO60931 367 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 APOL3O95236 402 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 CCDC159P0C7I6 412 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 TDGF1P13385 188 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 ARL4DP49703 201 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 C11orf91Q3C1V1 193 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 MINDY4Q4G0A6 757 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 FAM69BQ5VUD6 431 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 OR8D4Q8NGM9 314 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 MUL1Q969V5 352 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 PTCHD1Q96NR3 888 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 LANCL2Q9NS86 450 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 SLC7A7Q9UM01 511 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 A0A087WV62 115 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 A0A1W2PRQ8 180 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 GNB5O14775 395 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 ENTPD6O75354 484 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 TRMUO75648 421 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 TIAF1O95411 115 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 CH25HO95992 272 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 CLPSP04118 112 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 OSMP13725 252 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 GLB1P16278 677 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 UGT2B15P54855 530 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 GABARAPL2P60520 117 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 AQP6Q13520 282 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 PROX2Q3B8N5 592 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 PMS2CLQ68D20 193 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 PTCHD4Q6ZW05 846 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 PEX5LQ8IYB4 626 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 ZNF619Q8N2I2 560 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 CDRT4Q8N9R6 151 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 SLC38A9Q8NBW4 561 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 C16orf52Q8NHV5 167 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 ZNF675Q8TD23 568 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 ZNF566Q969W8 418 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 DGAT2Q96PD7 388 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 KLHDC3Q9BQ90 382 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 FUNDC2Q9BWH2 189 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 NRSN2Q9GZP1 204 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 IMPAD1Q9NX62 359 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 TVP23BQ9NYZ1 205 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 PILRBQ9UKJ0 227 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP13.04□□□□□ -0.322e-39■■■■■ 28.3
PRAME-205ENST00000405655 GPR52Q9Y2T5 361 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 SNX5Q9Y5X3 404 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 CDC14CA4D256 554 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 PRKYO43930 277 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 STX11O75558 287 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 PSMB9P28065 219 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 STT3AP46977 705 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 HSD11B2P80365 405 aa13.04□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
PRAME-205ENST00000405655 GNA13Q14344 377 aa13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.1 ms