RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384085.1

RNU6-38P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-38P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-38P-201ENST00000384085 GHRLQ9UBU3 117 aa1.87□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 DUSP12Q9UNI6 340 aa1.87□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 CHD4Q14839 1912 aa1.87□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP1.87□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 USP27XA6NNY8 438 aa1.86□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 PPIHO43447 177 aaKnown RBP1.86□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 SCRG1O75711 98 aa1.86□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 CABYRO75952 493 aa1.86□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 SUPT7LO94864 414 aa1.86□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 TIMP1P01033 207 aa1.86□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 STSP08842 583 aa1.86□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR8U8P0C7N1 319 aa1.86□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC35G4P0C7Q5 338 aa1.86□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 CCNA2P20248 432 aa1.86□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 CD1BP29016 333 aa1.86□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 LINC00315P59091 139 aa1.86□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP1.86□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 MORF4L2Q15014 288 aa1.86□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 KARSQ15046 597 aaKnown RBP1.86□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 UBE2V2Q15819 145 aa1.86□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa1.86□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP1.86□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 PPP1R27Q86WC6 154 aa1.86□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 CCDC170Q8IYT3 715 aa1.86□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 LRRC17Q8N6Y2 441 aa1.86□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa1.86□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP1.86□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 FBXO30Q8TB52 745 aa1.86□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 ATP6V1E2Q96A05 226 aa1.86□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 CCDC51Q96ER9 411 aa1.86□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF560Q96MR9 790 aa1.86□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 HOMER3Q9NSC5 361 aa1.86□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP1.86□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 CD274Q9NZQ7 290 aa1.86□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 ONECUT1Q9UBC0 465 aa1.86□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 SMC3Q9UQE7 1217 aa1.86□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP1.86□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 CACNG2Q9Y698 323 aa1.86□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZMYM6O95789 1325 aa1.86□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 TUBAL3A6NHL2 446 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 TCP11X1B4DZS4 312 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 IMPA2O14732 288 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 FMO6PO60774 539 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 RAMP1O60894 148 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP1.85□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 HMOX1P09601 288 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 MUTP22033 750 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 ADORA2BP29275 332 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 RPL4P36578 427 aaKnown RBP1.85□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 CASP3P42574 277 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 MAGEA4P43358 317 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 RPL29P47914 159 aaKnown RBP1.85□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 EMDP50402 254 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 GPC3P51654 580 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP1.85□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 HERVK_113P63132 956 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 ERVK-8P63133 956 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 LRRC36Q1X8D7 754 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP1.85□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF674Q2M3X9 581 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP1.85□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 CYBRD1Q53TN4 286 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 CYB5R2Q6BCY4 276 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 BTNL3Q6UXE8 466 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 CCDC91Q7Z6B0 441 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 UNC45BQ8IWX7 931 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF786Q8N393 782 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 SFRP1Q8N474 314 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 NKAIN3Q8N8D7 197 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZBTB44Q8NCP5 570 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 TAF4BQ92750 862 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 PTP4A1Q93096 173 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 DTD2Q96FN9 168 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMEM80Q96HE8 168 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP1.85□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 ERVK-6Q9BXR3 956 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP1.85□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 FANCFQ9NPI8 374 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP1.85□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR1A1Q9P1Q5 309 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP1.85□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP1.85□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP1.85□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 PARD3Q8TEW0 1356 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 A0A0J9YXY3 114 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 A0A1W2PRQ8 180 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 TTC26A0AVF1 554 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMEM89A2RUT3 159 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 SAGE2PA6NJ88 616 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 JCHAINP01591 159 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 CD55P08174 381 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 RPS2P15880 293 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 NTSP30990 170 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 UGT1A5P35504 534 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP1.84□□□□□ -2.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZP4Q12836 540 aa1.84□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms