RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 MAGEA5P43359 124 aa14.07□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 MAN2A2P49641 1150 aa14.07□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 KHKP50053 298 aa14.07□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 RCAN2Q14206 197 aa14.07□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 AGKQ53H12 422 aa14.07□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 C6orf10Q5SRN2 563 aa14.07□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 SAXO2Q658L1 398 aa14.07□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 DESI1Q6ICB0 168 aa14.07□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 MYO7BQ6PIF6 2116 aa14.07□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa14.07□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 INPP5KQ9BT40 448 aa14.07□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 LDAHQ9H6V9 325 aa14.07□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 EXO5Q9H790 373 aa14.07□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP14.07□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 ACKR4Q9NPB9 350 aa14.07□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 UBQLN4Q9NRR5 601 aa14.07□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 CCDC167Q9P0B6 97 aa14.07□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 KLHL14Q9P2G3 628 aa14.07□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 OSGIN2Q9Y236 505 aa14.07□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 C15orf41Q9Y2V0 281 aa14.07□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 WIF1Q9Y5W5 379 aa14.07□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP14.07□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa14.06□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 PCNX1Q96RV3 2341 aa14.06□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A1B0GUH1 482 aa14.06□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 NR5A2O00482 541 aa14.06□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 PRRG2O14669 202 aa14.06□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 SUSD5O60279 629 aa14.06□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 FADS1O60427 444 aa14.06□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC19A2O60779 497 aa14.06□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 TRAPPC6AO75865 159 aa14.06□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 PDE9AO76083 593 aa14.06□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 IGHG3P01860 377 aa14.06□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 STSP08842 583 aa14.06□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 ABOP16442 354 aa14.06□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 PTGS2P35354 604 aa14.06□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 PTGDSP41222 190 aa14.06□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 TOMM20Q15388 145 aa14.06□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 DCST2Q5T1A1 773 aa14.06□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 FIGNL1Q6PIW4 674 aa14.06□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 C16orf62Q7Z3J2 963 aa14.06□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 PLCZ1Q86YW0 608 aa14.06□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 SPPL2CQ8IUH8 684 aa14.06□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 EID3Q8N140 333 aa14.06□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 CLEC4FQ8N1N0 589 aa14.06□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF527Q8NB42 609 aa14.06□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 RNF138Q8WVD3 245 aa14.06□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 VPS33AQ96AX1 596 aa14.06□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 NTNG2Q96CW9 530 aa14.06□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 SPDL1Q96EA4 605 aa14.06□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP14.06□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 GNRHR2Q96P88 292 aa14.06□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP14.06□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 PHF12Q96QT6 1004 aa14.06□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 OR51I1Q9H343 314 aa14.06□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 GALNT9Q9HCQ5 603 aa14.06□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 PLSCR2Q9NRY7 297 aa14.06□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa14.06□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa14.05□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A1B0GTH9 108 aa14.05□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A1B0GVC2 190 aa14.05□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 OR14I1A6ND48 311 aa14.05□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 H3BNH8 94 aa14.05□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 SCDO00767 359 aa14.05□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 GNB5O14775 395 aa14.05□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 SCO2O43819 266 aa14.05□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 IGKV1D-16P01601 117 aa14.05□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 GSNP06396 782 aa14.05□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 RFPL3SP0C7P2 107 aa14.05□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 TBXA2RP21731 343 aa14.05□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 CDKN2CP42773 168 aa14.05□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 PER3P56645 1201 aa14.05□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 RPS26P62854 115 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 C17orf67Q0P5P2 114 aa14.05□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 CCNJQ5T5M9 372 aa14.05□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 FNDC7Q5VTL7 733 aa14.05□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 TRILQ7L0X0 811 aa14.05□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM26EQ8N5C1 309 aa14.05□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 OR4K17Q8NGC6 315 aa14.05□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 TSPEARQ8WU66 669 aa14.05□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 XAGE5Q8WWM1 108 aa14.05□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 RAD21L1Q9H4I0 556 aa14.05□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 PTGES2Q9H7Z7 377 aa14.05□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 SERHLQ9NQF3 203 aa14.05□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF835Q9Y2P0 537 aa14.05□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa14.04□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A1W2PP18 115 aa14.04□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 C2orf72A6NCS6 295 aa14.04□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 ALG1L2C9J202 215 aa14.04□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 AQP7O14520 342 aa14.04□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 BCKDKO14874 412 aa14.04□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 STX11O75558 287 aa14.04□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 HPNP05981 417 aa14.04□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 FREM3P0C091 2139 aa14.04□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 PTPN6P29350 595 aa14.04□□□□□ -0.16
PGGT1B-202ENST00000379615 HPCAP84074 193 aa14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms