RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF304Q9HCX3 659 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 CHRAC1Q9NRG0 131 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 ACTR10Q9NZ32 417 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 EXTL2Q9UBQ6 330 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 CPQQ9Y646 472 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa4.67□□□□□ -1.66
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PTPRD-201ENST00000355233 EPHX1P07099 455 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 ACRP10323 421 aa4.67□□□□□ -1.66
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PTPRD-201ENST00000355233 POU4F3Q15319 338 aa4.67□□□□□ -1.66
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PTPRD-201ENST00000355233 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 H3F3CQ6NXT2 135 aa4.67□□□□□ -1.66
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PTPRD-201ENST00000355233 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
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PTPRD-201ENST00000355233 ATG5Q9H1Y0 275 aa4.67□□□□□ -1.66
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PTPRD-201ENST00000355233 GPR148Q8TDV2 347 aa4.66□□□□□ -1.66
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PTPRD-201ENST00000355233 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
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PTPRD-201ENST00000355233 MUTYHQ9UIF7 546 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 TAF1P21675 1872 aa4.66□□□□□ -1.66
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PTPRD-201ENST00000355233 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
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PTPRD-201ENST00000355233 CDCA4Q9BXL8 241 aa4.66□□□□□ -1.66
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PTPRD-201ENST00000355233 DPPA3Q6W0C5 159 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
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