RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295987.12

SYN1-201, Transcript of synapsin I, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene SYN1, Length 3,299 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1-201ENST00000295987 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 LIMS3P0CW19 117 aa14.51□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 LIMS4P0CW20 117 aa14.51□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 SAGP10523 405 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 FGL2Q14314 439 aa14.51□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 CDC73Q6P1J9 531 aa14.51□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 OR13C5Q8NGS8 318 aa14.51□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 PFN4Q8NHR9 129 aa14.51□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 SLC25A46Q96AG3 418 aa14.51□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 WDR34Q96EX3 536 aa14.51□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 SLC6A20Q9NP91 592 aa14.51□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 MAN2B1O00754 1011 aa14.51□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 DPM1O60762 260 aa14.51□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 GCGRP47871 477 aa14.51□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 SLC36A4Q6YBV0 504 aa14.51□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 RAB42Q8N4Z0 105 aa14.51□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 PIGXQ8TBF5 258 aa14.51□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 LCN9Q8WX39 176 aa14.51□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 PATE1Q8WXA2 126 aa14.51□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 GALNT9Q9HCQ5 603 aa14.51□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 A0A1W2PQU0 124 aa14.51□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa14.51□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 E9PQ18 207 aa14.51□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 RPN2P04844 631 aa14.51□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 OR10A3P58181 314 aa14.51□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 REEP5Q00765 189 aa14.51□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 HYAL2Q12891 473 aa14.51□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 GPR50Q13585 617 aa14.51□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa14.51□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 IZUMO1Q8IYV9 350 aa14.51□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 LRIG1Q96JA1 1093 aa14.51□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 FRMD6Q96NE9 622 aa14.51□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 ZFP3Q96NJ6 502 aa14.51□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 HCAR1Q9BXC0 346 aa14.51□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa14.51□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa14.51□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 DSPPQ9NZW4 1301 aa14.51□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 LRRK1Q38SD2 2015 aa14.5□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 OBSL1O75147 1896 aa14.5□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 TRAV27A0A087WT01 109 aa14.5□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 TSPAN11A1L157 253 aa14.5□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 J3QLW9 94 aa14.5□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 UBXN7O94888 489 aa14.5□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 LGI1O95970 557 aa14.5□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 SYPP08247 313 aa14.5□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 ZNF19P17023 458 aa14.5□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 RAB30Q15771 203 aa14.5□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 PRSS41Q7RTY9 318 aa14.5□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 MORN4Q8NDC4 146 aa14.5□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 SUN3Q8TAQ9 357 aa14.5□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 MS4A6EQ96DS6 147 aa14.5□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 SLC35A4Q96G79 324 aa14.5□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa14.5□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 GPR34Q9UPC5 381 aa14.5□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 ICKQ9UPZ9 632 aa14.5□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 A0A0B4J293 547 aa14.5□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 C12orf71A8MTZ7 269 aa14.5□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 B4DXG7 233 aa14.5□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 PLA2G10O15496 165 aa14.5□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 KAT7O95251 611 aa14.5□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 CHRNB1P11230 501 aa14.5□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 PAICSP22234 425 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 DRD3P35462 400 aa14.5□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 SLC1A3P43003 542 aa14.5□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 SRP9P49458 86 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 TATDN3Q17R31 274 aa14.5□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 Q5BKY6 102 aa14.5□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 KIAA1211LQ6NV74 962 aa14.5□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 ARL14Q8N4G2 192 aa14.5□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 TMEM163Q8TC26 289 aa14.5□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 PRRC1Q96M27 445 aa14.5□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 PEX12O00623 359 aa14.49□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 TBXA2RP21731 343 aa14.49□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 SHC1P29353 583 aa14.49□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 NOS3P29474 1203 aa14.49□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 RAB28P51157 221 aa14.49□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 TFF2Q03403 129 aa14.49□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 KLHL22Q53GT1 634 aa14.49□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 MEDAGQ5VYS4 303 aa14.49□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 LYPD8Q6UX82 237 aa14.49□□□□□ -0.09
SYN1-201ENST00000295987 LINC00299Q6ZSB3 139 aa14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms