RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261205.8

SYT1-201, Transcript of synaptotagmin 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYT1, Length 4,808 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1-201ENST00000261205 DCTP40126 519 aa14.9□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 DAP3P51398 398 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 TMEM71Q6P5X7 295 aa14.9□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 QSOX2Q6ZRP7 698 aa14.9□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 GALNT10Q86SR1 603 aa14.9□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 PTTG2Q9NZH5 202 aa14.9□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 DAPP1Q9UN19 280 aa14.9□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 ZNF749O43361 778 aa14.89□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 CPOXP36551 454 aa14.89□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 NUDT6P53370 316 aa14.89□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 UGT8Q16880 541 aa14.89□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 OR2T11Q8NH01 316 aa14.89□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 GAB3Q8WWW8 586 aa14.89□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 TP53INP1Q96A56 240 aa14.89□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 AMDHD1Q96NU7 426 aa14.89□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 OR10A5Q9H207 317 aa14.89□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 PLD2O14939 933 aa14.89□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 ALOX12BO75342 701 aa14.89□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 CRABP1P29762 137 aa14.89□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 HOXD12P35452 270 aa14.89□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 MEP1AQ16819 746 aa14.89□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 KLHL17Q6TDP4 642 aa14.89□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 C1orf210Q8IVY1 113 aa14.89□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 CHST4Q8NCG5 386 aa14.89□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 MUTYHQ9UIF7 546 aa14.89□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 DHFRP00374 187 aa14.89□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 IL9P15248 144 aa14.89□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 TCN2P20062 427 aa14.89□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 RAB25P57735 213 aa14.89□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 FOXK1P85037 733 aa14.89□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 IL18Q14116 193 aa14.89□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 PARP8Q8N3A8 854 aa14.89□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 OMA1Q96E52 524 aa14.89□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa14.89□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 SLC23A2Q9UGH3 650 aa14.89□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 NUP205Q92621 2012 aa14.89□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 A0A1W2PPL8 197 aa14.89□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 CIB4A0PJX0 185 aa14.89□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 PLPP1O14494 284 aa14.89□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 PIAS2O75928 621 aa14.89□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 CD1CP29017 333 aa14.89□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 SSR4P51571 173 aa14.89□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 GABARAPL2P60520 117 aa14.89□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 CBLBQ13191 982 aa14.89□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 NKAIN2Q5VXU1 208 aa14.89□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 SHFQ7M4L6 423 aa14.89□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 MARCH9Q86YJ5 346 aa14.89□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 PELI3Q8N2H9 469 aa14.89□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 ACBD7Q8N6N7 88 aa14.89□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 OR5D16Q8NGK9 328 aa14.89□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 ZFP90Q8TF47 636 aa14.89□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 MUS81Q96NY9 551 aa14.89□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 STACQ99469 402 aa14.89□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 FAM118AQ9NWS6 357 aa14.89□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 PPT2Q9UMR5 302 aa14.89□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa14.88□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 RRP8O43159 456 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 SNAP29O95721 258 aa14.88□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 TLE3Q04726 772 aa14.88□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 SCN1BQ07699 218 aa14.88□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 LAPTM4AQ15012 233 aa14.88□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 GFOD2Q3B7J2 385 aa14.88□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 MARVELD2Q8N4S9 558 aa14.88□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 UXS1Q8NBZ7 420 aa14.88□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 GORASP1Q9BQQ3 440 aa14.88□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 TMEM38AQ9H6F2 299 aa14.88□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 GNG8Q9UK08 70 aa14.88□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 FTCDNL1E5RQL4 147 aa14.88□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 H2BFMP0C1H6 154 aa14.88□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 SDHBP21912 280 aa14.88□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 ADGRG5Q8IZF4 528 aa14.88□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa14.88□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 POMT2Q9UKY4 750 aa14.88□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa14.88□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 INMTO95050 263 aa14.88□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 LIM2P55344 173 aa14.88□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 ZXDBP98169 803 aa14.88□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 OR51G2Q8NGK0 314 aa14.88□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 A4GALTQ9NPC4 353 aa14.88□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
SYT1-201ENST00000261205 KIF13BQ9NQT8 1826 aa14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms