RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000220888.9

TRPS1-201, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 5,480 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-201ENST00000220888 SLC12A9Q9BXP2 914 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 POT1Q9NUX5 634 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 NEURL4Q96JN8 1562 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 TPPPO94811 219 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 PAHP00439 452 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 OPN1LWP04000 364 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 CREB1P16220 341 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 IL4RP24394 825 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 KDELR2P33947 212 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 LSSP48449 732 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 DCAF7P61962 342 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 FAM78AQ5JUQ0 283 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 ANKRD54Q6NXT1 300 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 HTR3DQ70Z44 454 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF367Q7RTV3 350 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF695Q8IW36 515 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 NRMQ8IXM6 262 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 TCEAL4Q96EI5 215 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 TIMD4Q96H15 378 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 SLC30A2Q9BRI3 323 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 TIMM29Q9BSF4 260 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 SLC46A2Q9BY10 475 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 POLE4Q9NR33 117 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 POLHQ9Y253 713 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 A0A1W2PPH5 198 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 H3BNC9 293 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 PTGESO14684 152 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 LSM1O15116 133 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 SURF4O15260 269 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 LRRTM2O43300 516 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 ADAM17P78536 824 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 APOFQ13790 326 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 SLC14A2Q15849 920 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 MEP1AQ16819 746 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 UGT8Q16880 541 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 KLBQ86Z14 1044 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 SFXN5Q8TD22 340 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 GCM1Q9NP62 436 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 TM7SF3Q9NS93 570 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 LRRC42Q9Y546 428 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 FUOMA2VDF0 154 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 GABRR3A8MPY1 467 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 RFXAPO00287 272 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 PRRG2O14669 202 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 CD97P48960 835 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF92Q03936 586 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 DTD2Q96FN9 168 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 TUBA1CQ9BQE3 449 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 XYLT2Q9H1B5 865 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 ZFP57Q9NU63 452 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 OR14J1Q9UGF5 321 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 OR5K3A6NET4 321 aa9.96□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 ENSAO43768 121 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 IL1AP01583 271 aa9.96□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 IFNA4P05014 189 aa9.96□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 AKR1C4P17516 323 aa9.96□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 IL2RGP31785 369 aa9.96□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 FOXN2P32314 431 aa9.96□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 RGS6P49758 472 aa9.96□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 ART1P52961 327 aa9.96□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 SCAPQ12770 1279 aa9.96□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 TECRLQ5HYJ1 363 aa9.96□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 C9orf152Q5JTZ5 239 aa9.96□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 KLHDC10Q6PID8 442 aa9.96□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 MS4A15Q8N5U1 240 aa9.96□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 TMEM40Q8WWA1 233 aa9.96□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 TOMM40LQ969M1 308 aa9.96□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF681Q96N22 645 aa9.96□□□□□ -0.81
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TRPS1-201ENST00000220888 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa9.96□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 TMEM59LQ9UK28 342 aa9.96□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 NID2Q14112 1375 aa9.96□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 F5H0A9 414 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 TRAPPC2LH3BP13 241 aa9.96□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 PPP1R3DO95685 299 aa9.96□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 SLC5A2P31639 672 aa9.96□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 CD83Q01151 205 aa9.96□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 PCLAFQ15004 111 aa9.96□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF423Q2M1K9 1284 aa9.96□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 LIPKQ5VXJ0 399 aa9.96□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 FAM180BQ6P0A1 224 aa9.96□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 OR14A16Q8NHC5 309 aa9.96□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 GAB3Q8WWW8 586 aa9.96□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 TAMM41Q96BW9 452 aa9.96□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
TRPS1-201ENST00000220888 RDH14Q9HBH5 336 aa9.96□□□□□ -0.81
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