RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000040584.5

HOXC8-201, Transcript of homeobox C8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC8, Length 1,889 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8-201ENST00000040584 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 GALNT12Q8IXK2 581 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 GIMAP5Q96F15 307 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 ZNF347Q96SE7 839 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 DOHHQ9BU89 302 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 OR51I1Q9H343 314 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 NUP210LQ5VU65 1888 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 A0A087WV62 115 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 HRKO00198 91 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 OR12D1P0DN82 309 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 ARAFP10398 606 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 VLDLRP98155 873 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 MAP4K2Q12851 820 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 NSDHLQ15738 373 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 NPTX1Q15818 432 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 C3orf38Q5JPI3 329 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 GALNT5Q7Z7M9 940 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 VWA5B2Q8N398 1253 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 ATG16L2Q8NAA4 619 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 GALNT6Q8NCL4 622 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 FAR1Q8WVX9 515 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 LRFN5Q96NI6 719 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 PITX2Q99697 317 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 DGCR6LQ9BY27 220 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 A4GALTQ9NPC4 353 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 ADAP2Q9NPF8 381 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 KNTC1P50748 2209 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 hCG_2039718K7EN88 272 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 MITFO75030 526 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 TNNI3P19429 210 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 CDK6Q00534 326 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 BIKQ13323 160 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 SCARB2Q14108 478 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 CNIH3Q8TBE1 160 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 MR1Q95460 341 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 COX4I2Q96KJ9 171 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 MS4A4EQ96PG1 132 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 SATB2Q9UPW6 733 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 A8MUA0 341 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 ADAMDEC1O15204 470 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 STK17BO94768 372 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 GABARAPO95166 117 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 CBX7O95931 251 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 S1PR1P21453 382 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 ACVR2AP27037 513 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 KHKP50053 298 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 PGDP52209 483 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 GP2P55259 537 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 SELENOWP63302 87 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP20.47■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 MARCH9Q86YJ5 346 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 NFKBIDQ8NI38 313 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 GIPC3Q8TF64 312 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 XAGE5Q8WWM1 108 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 S100ZQ8WXG8 99 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 C7orf34Q96L11 122 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 ZPBPQ9BS86 351 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 DDA1Q9BW61 102 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 C14orf105Q9NVL8 296 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 VSTM2BA6NLU5 285 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 C9orf172C9J069 976 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 RGS10O43665 173 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 TFPTP0C1Z6 253 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 SERPINB10P48595 397 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 MAN2A2P49641 1150 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 ST13P50502 369 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 CRYBA2P53672 197 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 IL1RL1Q01638 556 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 NPRL3Q12980 569 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 FAAH2Q6GMR7 532 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 MFSD12Q6NUT3 480 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 PRSS48Q7RTY5 328 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 VTCN1Q7Z7D3 282 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 GALNT10Q86SR1 603 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 ZNF554Q86TJ5 538 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 PLPP5Q8NEB5 264 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 OR52R1Q8NGF1 315 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 SLC38A5Q8WUX1 472 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 SGCDQ92629 289 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 CFAP54Q96N23 3096 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXC8-201ENST00000040584 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms