RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 FRKP42685 505 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 MLC1Q15049 377 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF793Q6ZN11 406 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 ABHD13Q7L211 337 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 MDGA2Q7Z553 956 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 AQP12AQ8IXF9 295 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 RNF148Q8N7C7 305 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 CDC26Q8NHZ8 85 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF583Q96ND8 569 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 PTCHD1Q96NR3 888 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 ECSITQ9BQ95 431 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 INPP5KQ9BT40 448 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIM15Q9C019 465 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 S100A14Q9HCY8 104 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 NECTIN3Q9NQS3 549 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 PACSIN3Q9UKS6 424 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 PCDHGB4Q9UN71 923 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 ACANP16112 2415 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 C4orf51C9J302 202 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 TPOP07202 933 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 GPX2P18283 190 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 MAOAP21397 527 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 SLAMF1Q13291 335 aa22.24■■□□□ 1.15
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CAPNS1-216ENST00000628306 NIPAL1Q6NVV3 410 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 DHFR2Q86XF0 187 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 EID3Q8N140 333 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 OR52E4Q8NGH9 312 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 SERINC2Q96SA4 455 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 MS4A12Q9NXJ0 267 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 CORO2BQ9UQ03 480 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 CLDN16Q9Y5I7 305 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 EVPLLA8MZ36 301 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 TFECO14948 347 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 ANP32DO95626 131 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 C8BP07358 591 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 AKAP6Q13023 2319 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF385BQ569K4 471 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 CALHM3Q86XJ0 350 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIML2Q8N7C3 387 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 OR52N2Q8NGI0 321 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 OR5P2Q8WZ92 322 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 NRGNQ92686 78 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 SPATA9Q9BWV2 254 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 DEPPQ9NTK1 212 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 ERVK-11Q9UQG0 969 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A1W2PRB8 838 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 C1orf226A1L170 272 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 PEX1O43933 1283 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 MPEG1Q2M385 716 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 SERPINA11Q86U17 422 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 ANKRD46Q86W74 232 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 ASB5Q8WWX0 329 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 TMUB1Q9BVT8 246 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 TAS2R9Q9NYW1 312 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 SNX13Q9Y5W8 968 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM90A27PA6NNH2 459 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 PROM1O43490 865 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 KRT36O76013 467 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 CHRNB4P30926 498 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 CDKN2CP42773 168 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 GZMMP51124 257 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 GPR143P51810 404 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 ART1P52961 327 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 BTN3A2P78410 334 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC34A1Q06495 639 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF621Q6ZSS3 439 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM156AQ8NDB6 213 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 PSMA8Q8TAA3 256 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC26A7Q8TE54 656 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 PCDHAC1Q9H158 963 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 GORASP2Q9H8Y8 452 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 LYRM4Q9HD34 91 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC6A13Q9NSD5 602 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 STOML1Q9UBI4 398 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 PHF11Q9UIL8 331 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
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