RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-204ENST00000587718 EFCAB10A6NFE3 127 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-204ENST00000587718 FFAR1O14842 300 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC35G6P0C7Q6 338 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-204ENST00000587718 SMIM10L1P0DMW3 83 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
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CAPNS1-204ENST00000587718 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
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CAPNS1-204ENST00000587718 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-204ENST00000587718 SMIM10Q96HG1 83 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF681Q96N22 645 aa23.77■■□□□ 1.4
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CAPNS1-204ENST00000587718 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
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CAPNS1-204ENST00000587718 PRRC1Q96M27 445 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-204ENST00000587718 RACGAP1Q9H0H5 632 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-204ENST00000587718 ANKRD19PQ9H560 264 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-204ENST00000587718 RHPN2P1A8MT19 583 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-204ENST00000587718 ERVH48-1M5A8F1 160 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-204ENST00000587718 UGT2B17O75795 530 aa23.73■■□□□ 1.39
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