RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 TBC1D3BA6NDS4 549 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 A8MX80 341 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 M0R129 80 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 BTN3A3O00478 584 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 PDCD5O14737 125 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 PGRMC2O15173 223 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 KLF4O43474 513 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 RNF13O43567 381 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 GPRIN2O60269 458 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 LILRB5O75023 590 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 SERPINI2O75830 405 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 CSF2P04141 144 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 CPN1P15169 458 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 BMP7P18075 431 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 CELP19835 753 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 GKP32189 559 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 ETV3P41162 512 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 PREPP48147 710 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 CTSCP53634 463 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 PRMT2P55345 433 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 MC1RQ01726 317 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 SNTA1Q13424 505 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 CAMK1Q14012 370 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 GALEQ14376 348 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 GPR176Q14439 515 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC9A5Q14940 896 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 CEBPEQ15744 281 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 NTRK2Q16620 822 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 ELFN2Q5R3F8 820 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 METTL11BQ5VVY1 283 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 TXNDC8Q6A555 127 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 OR4C11Q6IEV9 310 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 ACSM5Q6NUN0 579 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 WASH2PQ6VEQ5 465 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF620Q6ZNG0 422 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 Q6ZVU0 165 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 TAS1R1Q7RTX1 841 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 ADGRG3Q86Y34 549 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 CFAP206Q8IYR0 622 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 SYS1Q8N2H4 156 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 RNF175Q8N4F7 328 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 TOMM5Q8N4H5 51 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM71CQ8NEG0 241 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF680Q8NEM1 530 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 OR8K5Q8NH50 307 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 OR5K2Q8NHB8 316 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 GATAD2BQ8WXI9 593 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 DIO2Q92813 273 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 IRF7Q92985 503 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 SCAMP4Q969E2 229 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 PHF21AQ96BD5 680 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 NXPE2Q96DL1 559 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 NUS1Q96E22 293 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 HHIPL1Q96JK4 782 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 HS6ST2Q96MM7 605 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 IFT27Q9BW83 186 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM168Q9H0V1 697 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 OR51J1Q9H342 316 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 C11orf49Q9H6J7 331 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 PLEKHA1Q9HB21 404 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 NTMQ9P121 344 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 TRPC4Q9UBN4 977 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 CAMK2AQ9UQM7 478 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 SPEF1Q9Y4P9 236 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 DENND4AQ7Z401 1863 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 CCDC88CQ9P219 2028 aa7.24□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 A0A087WUU8 490 aa7.24□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 A0A1B0GUH1 482 aa7.24□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa7.24□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 A8MV72 311 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 LEUTXA8MZ59 168 aa7.24□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF879B4DU55 563 aa7.24□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 KRBOX1C9JBD0 128 aa7.24□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 J3QRE1 110 aa7.24□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 LEFTY1O75610 366 aa7.24□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 RGS11O94810 467 aa7.24□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 KLHL18O94889 574 aa7.24□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 WDPCPO95876 746 aa7.24□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 LALBAP00709 142 aa7.24□□□□□ -1.25
CAPNS1-202ENST00000586851 IFNGP01579 166 aa7.24□□□□□ -1.25
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