RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 SDC1P18827 310 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 GABRA3P34903 492 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 ASMTP46597 345 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 SERPINB4P48594 390 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 CLK3P49761 638 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 PNLIPRP2P54317 469 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 PSPHP78330 225 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 SNTA1Q13424 505 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP7.6□□□□□ -1.191e-8■■■■■ 37.2
PTPRM-214ENST00000583153 CHI3L2Q15782 390 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 DECR1Q16698 335 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 CT45A2Q5DJT8 189 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 OR5M10Q6IEU7 315 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 NPSR1Q6W5P4 371 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 EXOC3L1Q86VI1 746 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 PM20D2Q8IYS1 436 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 OR4N2Q8NGD1 307 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 LILRB4Q8NHJ6 448 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP7.6□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 TUBGCP3Q96CW5 907 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 DTNBP1Q96EV8 351 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 PPP1R36Q96LQ0 422 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 ANKRD27Q96NW4 1050 aa7.6□□□□□ -1.19
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PTPRM-214ENST00000583153 TIMP4Q99727 224 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 UCK2Q9BZX2 261 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 RABEP2Q9H5N1 569 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 C3orf14Q9HBI5 128 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 Q9N2J8 555 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 EQTNQ9NQ60 294 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 SERHLQ9NQF3 203 aa7.6□□□□□ -1.19
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PTPRM-214ENST00000583153 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
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PTPRM-214ENST00000583153 SCO2O43819 266 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 TSPAN2O60636 221 aa7.59□□□□□ -1.19
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PTPRM-214ENST00000583153 CYP4B1P13584 511 aa7.59□□□□□ -1.19
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PTPRM-214ENST00000583153 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
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PTPRM-214ENST00000583153 SRYQ05066 204 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 GAB1Q13480 694 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 C11orf91Q3C1V1 193 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 UGT3A2Q3SY77 523 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 CYP27C1Q4G0S4 372 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 FNDC7Q5VTL7 733 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 IL23RQ5VWK5 629 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 RTL6Q6ICC9 239 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM81Q6P7N7 255 aa7.59□□□□□ -1.19
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PTPRM-214ENST00000583153 RNF165Q6ZSG1 346 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 GDF7Q7Z4P5 450 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 PLCZ1Q86YW0 608 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 ULK2Q8IYT8 1036 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 OR2L13Q8N349 312 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 FNDC5Q8NAU1 212 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 NUP43Q8NFH3 380 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 OR4K17Q8NGC6 315 aa7.59□□□□□ -1.19
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PTPRM-214ENST00000583153 PGM2Q96G03 612 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 SLC35A4Q96G79 324 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 TRIB1Q96RU8 372 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 C1orf50Q9BV19 199 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 SDHAF3Q9NRP4 125 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 TAS2R10Q9NYW0 307 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRM-214ENST00000583153 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa7.59□□□□□ -1.19
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