RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577827.5

PTPRM-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 4,640 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-205ENST00000577827 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 DPEP2Q9H4A9 486 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 TMEM184CQ9NVA4 438 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 CNIH4Q9P003 139 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 KCNK6Q9Y257 313 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 RASD1Q9Y272 281 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 WNT6Q9Y6F9 365 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 NHSQ6T4R5 1651 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 KRBOX1C9JBD0 128 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 GFRA2O00451 464 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 KCNJ13O60928 360 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 MTNR1BP49286 362 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 MC1RQ01726 317 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 KIAA1211LQ6NV74 962 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 HERVK_113Q902F9 699 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 EMC7Q9NPA0 242 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 A8MVJ9 347 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 NR2C1P13056 603 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 AKT2P31751 481 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 RAB28P51157 221 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 OCLNQ16625 522 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 ACSM3Q53FZ2 586 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 MLIPQ5VWP3 458 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 CPXM2Q8N436 756 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 SCLYQ96I15 445 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 PITX2Q99697 317 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 SYT4Q9H2B2 425 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 ELOVL2Q9NXB9 296 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 EMC3Q9P0I2 261 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 F5H5P2 479 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 TNFRSF10BO14763 440 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 IGLV3-25P01717 112 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 CSF1P09603 554 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 GIFP27352 417 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 CD70P32970 193 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 EVI2BP34910 448 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 BLKP51451 505 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 ABCA11PQ4W5N1 156 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 AFMIDQ63HM1 303 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 AVL9Q8NBF6 648 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 KCT2Q8NC54 265 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 OR4E2Q8NGC2 313 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 OR8S1Q8NH09 359 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 AUTS2Q8WXX7 1259 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 MS4A4EQ96PG1 132 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 ATG5Q9H1Y0 275 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 P2RY12Q9H244 342 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 CWH43Q9H720 699 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 CENPMQ9NSP4 180 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 ASB6Q9NWX5 421 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 TAPBPO15533 448 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 KCTD9Q7L273 389 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 SLC22A15Q8IZD6 547 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 CASTOR1Q8WTX7 329 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 TTTY10Q9BZA0 68 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 J3KTA2 159 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 ARPC5O15511 151 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 ICMTO60725 284 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 CSO75390 466 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 NDUFB2O95178 105 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 STATHP02808 62 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 MMP2P08253 660 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 APEX1P27695 318 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 GABRA3P34903 492 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 SLC1A3P43003 542 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 SOX9P48436 509 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 RAB33AQ14088 237 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 POU4F3Q15319 338 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 SLC25A46Q96AG3 418 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 SLC25A36Q96CQ1 311 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF350Q9GZX5 532 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 NANSQ9NR45 359 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 GLTPQ9NZD2 209 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 PRODH2Q9UF12 536 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 ADAM29Q9UKF5 820 aa9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms