RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 CDR2Q01850 454 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 DMWDQ09019 674 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 SLC13A2Q13183 592 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 PDE7AQ13946 482 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 KRT81Q14533 505 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 SLC29A2Q14542 456 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ACOX1Q15067 660 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 VAMP3Q15836 100 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 CCDC6Q16204 474 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 EXT1Q16394 746 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 RBBP7Q16576 425 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM249Q2WGJ8 235 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 RNF212Q495C1 297 aa2.85□□□□□ -1.95
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PTPRM-204ENST00000577468 ZNF766Q5HY98 468 aa2.85□□□□□ -1.95
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PTPRM-204ENST00000577468 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
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PTPRM-204ENST00000577468 C17orf99Q6UX52 265 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 HSDL2Q6YN16 418 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 C3P1Q6ZMU1 363 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 CFAP77Q6ZQR2 320 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 LINC00299Q6ZSB3 139 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ASB18Q6ZVZ8 466 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 CENPUQ71F23 418 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 SLC16A14Q7RTX9 510 aa2.85□□□□□ -1.95
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PTPRM-204ENST00000577468 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
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PTPRM-204ENST00000577468 LACC1Q8IV20 430 aa2.85□□□□□ -1.95
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PTPRM-204ENST00000577468 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 MARVELD2Q8N4S9 558 aa2.85□□□□□ -1.95
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PTPRM-204ENST00000577468 WDSUB1Q8N9V3 476 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa2.85□□□□□ -1.95
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PTPRM-204ENST00000577468 OR9A2Q8NGT5 310 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 OR2L2Q8NH16 312 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF398Q8TD17 642 aa2.85□□□□□ -1.95
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PTPRM-204ENST00000577468 SORCS1Q8WY21 1168 aa2.85□□□□□ -1.95
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PTPRM-204ENST00000577468 FAM46BQ96A09 425 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ESAMQ96AP7 390 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 KLHL29Q96CT2 875 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 L3HYPDHQ96EM0 354 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 FAHD2AQ96GK7 314 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 AKR1E2Q96JD6 320 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 FOPNLQ96NB1 174 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 PANX3Q96QZ0 392 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 RNF2Q99496 336 aa2.85□□□□□ -1.95
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PTPRM-204ENST00000577468 TIMP4Q99727 224 aa2.85□□□□□ -1.95
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PTPRM-204ENST00000577468 PTDSS2Q9BVG9 487 aa2.85□□□□□ -1.95
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PTPRM-204ENST00000577468 GPR88Q9GZN0 384 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 HRH4Q9H3N8 390 aa2.85□□□□□ -1.95
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PTPRM-204ENST00000577468 UGT1A8Q9HAW9 530 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 LYRM4Q9HD34 91 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 IL1RAPQ9NPH3 570 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 OR2S2Q9NQN1 319 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 DYRK4Q9NR20 520 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 PXMP2Q9NR77 195 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM74BQ9NUR3 256 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 HAO2Q9NYQ3 351 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 RDH8Q9NYR8 311 aa2.85□□□□□ -1.95
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