RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568232.1

CLK3-222, Transcript of CDC like kinase 3, human

Gene CLK3, Length 958 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLK3-222	ENST00000568232	PPIC	P45877	212 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	EMD	P50402	254 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	DEFA6	Q01524	100 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	DUSP2	Q05923	314 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	SLMAP	Q14BN4	828 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	OR4D1	Q15615	310 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	TRMT12	Q53H54	448 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	SULT1C3	Q6IMI6	304 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	GGN	Q86UU5	652 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	STK32C	Q86UX6	486 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	FADS6	Q8N9I5	356 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	BANP	Q8N9N5	519 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	RNF138	Q8WVD3	245 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	HSD17B8	Q92506	261 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	ZMYND19	Q96E35	227 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	DTNBP1	Q96EV8	351 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	SLC35A4	Q96G79	324 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	HBEGF	Q99075	208 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	CENPK	Q9BS16	269 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	ANKRA2	Q9H9E1	313 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	MAT2B	Q9NZL9	334 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	CD274	Q9NZQ7	290 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	XPR1	Q9UBH6	696 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	ZNF639	Q9UID6	485 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	CFL2	Q9Y281	166 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	T	O15178	435 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	VENTX	O95231	258 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	TTC4	O95801	387 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	AVP	P01185	164 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	IL32	P24001	234 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	SERPINB1	P30740	379 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	TTK	P33981	857 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	FEN1	P39748	380 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	CORO7	P57737	925 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	MAP4K2	Q12851	820 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	STX5	Q13190	355 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	FAM180B	Q6P0A1	224 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	10.44	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	GABRG1	Q8N1C3	465 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	GBP7	Q8N8V2	638 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	OR52B6	Q8NGF0	335 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	MAIP1	Q8WWC4	291 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	EXT2	Q93063	718 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	EFHD2	Q96C19	240 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	NXNL1	Q96CM4	212 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	SOX7	Q9BT81	388 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	RTN4R	Q9BZR6	473 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	CD244	Q9BZW8	370 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	SNX8	Q9Y5X2	465 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232		A0A0G2JK05	382 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232		E7EQL1	145 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	ABCD4	O14678	606 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	GMFG	O60234	142 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	ADA	P00813	363 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	CT45A8	P0DMV1	189 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	CT45A9	P0DMV2	189 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	COL6A2	P12110	1019 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	AGTR1	P30556	359 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	CXCR5	P32302	372 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	PIK3CB	P42338	1070 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	MRPS35	P82673	323 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	P2RY6	Q15077	328 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	LTB4R	Q15722	352 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	CT45A2	Q5DJT8	189 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	LGSN	Q5TDP6	509 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	ZC3HC1	Q86WB0	502 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	CCDC25	Q86WR0	208 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	CEP112	Q8N8E3	955 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	PDPR	Q8NCN5	879 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	OR4N2	Q8NGD1	307 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	OR10D3	Q8NH80	312 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	CFAP36	Q96G28	342 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	TRIM5	Q9C035	493 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	DERL2	Q9GZP9	239 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	FLRT3	Q9NZU0	649 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	GUCA1B	Q9UMX6	200 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	AP4B1	Q9Y6B7	739 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	SERINC4	A6NH21	518 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	VWC2L	B2RUY7	222 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	LINC01387	J3KSC0	135 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	CXCL13	O43927	109 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	ERAL1	O75616	437 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	CCDC166	P0CW27	439 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	PCSK2	P16519	638 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CLK3-222	ENST00000568232	IL12B	P29460	328 aa		10.42	□□□□□ -0.74

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