RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557428.1

PCNX1-215, Transcript of pecanex 1, humanhuman

TSL 4

Gene PCNX1, Length 541 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1-215ENST00000557428 LAS2Q8IYD9 372 aa7.22□□□□□ -1.25
PCNX1-215ENST00000557428 C17orf47Q8NEP4 570 aa7.22□□□□□ -1.25
PCNX1-215ENST00000557428 OR52R1Q8NGF1 315 aa7.22□□□□□ -1.25
PCNX1-215ENST00000557428 OR6K3Q8NGY3 331 aa7.22□□□□□ -1.25
PCNX1-215ENST00000557428 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PCNX1-215ENST00000557428 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PCNX1-215ENST00000557428 S100PBPQ96BU1 408 aa7.22□□□□□ -1.25
PCNX1-215ENST00000557428 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PCNX1-215ENST00000557428 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa7.22□□□□□ -1.25
PCNX1-215ENST00000557428 ADOQ96SZ5 270 aa7.22□□□□□ -1.25
PCNX1-215ENST00000557428 FMO2Q99518 471 aa7.22□□□□□ -1.25
PCNX1-215ENST00000557428 DERL2Q9GZP9 239 aa7.22□□□□□ -1.25
PCNX1-215ENST00000557428 DSN1Q9H410 356 aa7.22□□□□□ -1.25
PCNX1-215ENST00000557428 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PCNX1-215ENST00000557428 CAB39LQ9H9S4 337 aa7.22□□□□□ -1.25
PCNX1-215ENST00000557428 PFDN4Q9NQP4 134 aa7.22□□□□□ -1.25
PCNX1-215ENST00000557428 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa7.22□□□□□ -1.25
PCNX1-215ENST00000557428 OPTCQ9UBM4 332 aa7.22□□□□□ -1.25
PCNX1-215ENST00000557428 ZNF175Q9Y473 711 aa7.22□□□□□ -1.25
PCNX1-215ENST00000557428 DYSFO75923 2080 aa7.22□□□□□ -1.25
PCNX1-215ENST00000557428 SHISA8B8ZZ34 492 aa7.21□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 ACOX3O15254 700 aa7.21□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 ZIC3O60481 467 aa7.21□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 TNFRSF21O75509 655 aa7.21□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 FESP07332 822 aa7.21□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 DANCRP0C864 163 aa7.21□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 IGHV4-31P0DP07 118 aa7.21□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 PORP16435 677 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
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PCNX1-215ENST00000557428 SSTR1P30872 391 aa7.21□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 PHBP35232 272 aa7.21□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 GGT5P36269 586 aa7.21□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 SLC6A8P48029 635 aa7.21□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 B3GALT5-AS1P59052 145 aa7.21□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 VLDLRP98155 873 aa7.21□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 BSPH1Q075Z2 132 aa7.21□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 LTB4RQ15722 352 aa7.21□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 NRF1Q16656 503 aa7.21□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 NCMAPQ5T1S8 102 aa7.21□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 GRHL2Q6ISB3 625 aa7.21□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 FAM180BQ6P0A1 224 aa7.21□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 BHLHB9Q6PI77 547 aa7.21□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 BEND4Q6ZU67 534 aa7.21□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 CYS1Q717R9 158 aa7.21□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP7.21□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 TEX9Q8N6V9 391 aa7.21□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 ZNF525Q8N782 197 aa7.21□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 PDPRQ8NCN5 879 aa7.21□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 CDKL2Q92772 493 aa7.21□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 C3orf49Q96BT1 292 aa7.21□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 CACNG6Q9BXT2 260 aa7.21□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 CD244Q9BZW8 370 aa7.21□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 NGBQ9NPG2 151 aa7.21□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 FAIMQ9NVQ4 179 aa7.21□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 TMEM160Q9NX00 188 aa7.21□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa7.21□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 MED11Q9P086 117 aa7.21□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 TXNDC16Q9P2K2 825 aa7.21□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 NFU1Q9UMS0 254 aa7.21□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 ZNF337Q9Y3M9 751 aa7.21□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa7.21□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa7.2□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 PCNX3Q9H6A9 2034 aa7.2□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 OR2M5A3KFT3 312 aa7.2□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 GOLGA6L10A6NI86 522 aa7.2□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 OR6C70A6NIJ9 312 aa7.2□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 K7EPI3 171 aa7.2□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 UBXN8O00124 270 aa7.2□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 NME6O75414 186 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 PIAS1O75925 651 aa7.2□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 SYNGR4O95473 234 aa7.2□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 OPN1LWP04000 364 aa7.2□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 PGRP06401 933 aa7.2□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 CD1DP15813 335 aa7.2□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 PCSK2P16519 638 aa7.2□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 STX2P32856 288 aa7.2□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 BSGP35613 385 aa7.2□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 PIK3CBP42338 1070 aa7.2□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 PIK3CGP48736 1102 aa7.2□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 ALDH9A1P49189 494 aa7.2□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 C21orf58P58505 322 aa7.2□□□□□ -1.26
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PCNX1-215ENST00000557428 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 IRF9Q00978 393 aa7.2□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 EFR3AQ14156 821 aa7.2□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 GGTLC2Q14390 218 aa7.2□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 STK11Q15831 433 aa7.2□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP7.2□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 PGGHGQ32M88 737 aa7.2□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 SH2D4BQ5SQS7 431 aa7.2□□□□□ -1.26
PCNX1-215ENST00000557428 FAM120AOSQ5T036 256 aa7.2□□□□□ -1.26
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