RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551968.5

CS-230, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-230ENST00000551968 CT45A9P0DMV2 189 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 PCSK2P16519 638 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 HNF1AP20823 631 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 TTKP33981 857 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 FEN1P39748 380 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 GPX6P59796 221 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 SPOCK1Q08629 439 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 P2RY6Q15077 328 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 CT45A2Q5DJT8 189 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 AGAP6Q5VW22 663 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 GRHL2Q6ISB3 625 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 B3GLCTQ6Y288 498 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP12.12□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 GALNT10Q86SR1 603 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 C3orf56Q8N813 242 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 PPM1NQ8N819 430 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 BANPQ8N9N5 519 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 OR10D3Q8NH80 312 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 CFAP36Q96G28 342 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 ADGRG7Q96K78 797 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 DERL2Q9GZP9 239 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 CAB39LQ9H9S4 337 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 CD274Q9NZQ7 290 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 CES1P1Q9UKY3 287 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 A0A0G2JK05 382 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 SERINC4A6NH21 518 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 ABCD4O14678 606 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 CXCL13O43927 109 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 GMFGO60234 142 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 DLX3O60479 287 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 TTC4O95801 387 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 TGFAP01135 160 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 CD1DP15813 335 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 IL32P24001 234 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 SERPINB1P30740 379 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 CXCR5P32302 372 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 PIK3CBP42338 1070 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 COMPP49747 757 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 SLMAPQ14BN4 828 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 RAB35Q15286 201 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 TMEM44Q2T9K0 475 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 LGSNQ5TDP6 509 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 C6orf163Q5TEZ5 329 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 TFAP2EQ6VUC0 442 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 OR52B6Q8NGF0 335 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 HSD17B8Q92506 261 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 CBLN4Q9NTU7 201 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 FAIMQ9NVQ4 179 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 CFL2Q9Y281 166 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 PIAS1O75925 651 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 ADAP00813 363 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 ATP1B1P05026 303 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 FESP07332 822 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 CCDC166P0CW27 439 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 EVI2BP34910 448 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 DEKP35659 375 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 STK32CQ86UX6 486 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 NUDT13Q86X67 352 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 PPIL6Q8IXY8 311 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 TXLNBQ8N3L3 684 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 BTBD9Q96Q07 612 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 CENPKQ9BS16 269 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 MCMBPQ9BTE3 642 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 LRRC1Q9BTT6 524 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 TRIM5Q9C035 493 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 NGBQ9NPG2 151 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 FANCFQ9NPI8 374 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 GUCA1BQ9UMX6 200 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 CHMP2BQ9UQN3 213 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 AP4B1Q9Y6B7 739 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 VWFP04275 2813 aa12.09□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 ZNF814B7Z6K7 855 aa12.09□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 H7C417 338 aa12.09□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 FADS1O60427 444 aa12.09□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 TUBBP07437 444 aa12.09□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 APEHP13798 732 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 NR4A2P43354 598 aa12.09□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 PIK3CGP48736 1102 aa12.09□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 ARFIP1P53367 373 aa12.09□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 EFR3AQ14156 821 aa12.09□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 CDKL4Q5MAI5 379 aa12.09□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 CCDC25Q86WR0 208 aa12.09□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 CEP112Q8N8E3 955 aa12.09□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 MAIP1Q8WWC4 291 aa12.09□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
CS-230ENST00000551968 HDHD5Q9BXW7 423 aa12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.2 ms