RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550658.1

SYF2P1-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene SYF2P1, Length 413 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2P1-201ENST00000550658 ASB6Q9NWX5 421 aa3.25□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 DLL3Q9NYJ7 618 aa3.25□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 CLN8Q9UBY8 286 aa3.25□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 STOML2Q9UJZ1 356 aa3.25□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 C3orf18Q9UK00 162 aa3.25□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa3.25□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 RNF6Q9Y252 685 aa3.25□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 POFUT2Q9Y2G5 429 aa3.25□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 STARD10Q9Y365 291 aa3.25□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 CHST2Q9Y4C5 530 aa3.25□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 LRRC42Q9Y546 428 aa3.25□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa3.25□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa3.25□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 KLK4Q9Y5K2 254 aa3.25□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 FADS3Q9Y5Q0 445 aa3.25□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa3.25□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 SCRIBQ14160 1630 aa3.25□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa3.25□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa3.25□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 ZMYM6O95789 1325 aa3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 AFF2P51816 1311 aa3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 A0A1W2PNV4 684 aa3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 A0A1W2PRD5 423 aa3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 FABP12A6NFH5 140 aa3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 TMEM200CA6NKL6 621 aa3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 SHISA7A6NL88 538 aa3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 CENPXA8MT69 81 aa3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 A8MX80 341 aa3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 HHLA1C9JL84 531 aa3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 DIRC3C9JPN6 131 aa3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 CYB561D2O14569 222 aa3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 RFXANKO14593 260 aa3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 MSI1O43347 362 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 EMC8O43402 210 aa3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 PLPP2O43688 288 aa3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 SNX3O60493 162 aa3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 HSBP1O75506 76 aa3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 ATP6AP2O75787 350 aa3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 OR2J3O76001 311 aa3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 DEXIO95424 95 aa3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 F10P00742 488 aa3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 RAF1P04049 648 aa3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 FABP1P07148 127 aa3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 OR4E1P0C645 316 aa3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 SMIM10L1P0DMW3 83 aa3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 ETS2P15036 469 aa3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 B4GALT1P15291 398 aa3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 PPP3CBP16298 524 aa3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 NCK1P16333 377 aa3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 MAGP20916 626 aa3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 HSD11B1P28845 292 aa3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 PPP2R1BP30154 601 aa3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 PTGER4P35408 488 aa3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 UGT1A5P35504 534 aa3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 MMP12P39900 470 aa3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC26A3P40879 764 aa3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 OR3A3P47888 321 aa3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 AVPR1BP47901 424 aa3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 CHN2P52757 468 aa3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 PLK1P53350 603 aa3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 PLA2G16P53816 162 aa3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 RAB10P61026 200 aa3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 RPS6P62753 249 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 GABPAQ06546 454 aa3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 CYP24A1Q07973 514 aa3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 TROAPQ12815 778 aa3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 SMARCB1Q12824 385 aa3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 MYBPHQ13203 477 aa3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 ITIH4Q14624 930 aa3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 BEAN1Q3B7T3 259 aa3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 GPR33Q49SQ1 333 aa3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 ESCO2Q56NI9 601 aa3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 MTX3Q5HYI7 312 aa3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 FAM69BQ5VUD6 431 aa3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 LIPNQ5VXI9 398 aa3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 STUMQ69YW2 141 aa3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 OR52W1Q6IF63 320 aa3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 FBXO42Q6P3S6 717 aa3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 PLXDC2Q6UX71 529 aa3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 GDPD4Q6W3E5 623 aa3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 HSDL2Q6YN16 418 aa3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 G2E3Q7L622 706 aa3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 ACOT1Q86TX2 421 aa3.24□□□□□ -1.89
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF546Q86UE3 836 aa3.24□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.6 ms