RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550655.5

CS-219, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-219ENST00000550655 PCNX3Q9H6A9 2034 aa16.16■□□□□ 0.18
CS-219ENST00000550655 MED12Q93074 2177 aa16.16■□□□□ 0.18
CS-219ENST00000550655 TTC36A6NLP5 189 aa16.15■□□□□ 0.18
CS-219ENST00000550655 FADS1O60427 444 aa16.15■□□□□ 0.18
CS-219ENST00000550655 NKX2-2O95096 273 aa16.15■□□□□ 0.18
CS-219ENST00000550655 IL33O95760 270 aa16.15■□□□□ 0.18
CS-219ENST00000550655 IGKV1D-16P01601 117 aa16.15■□□□□ 0.18
CS-219ENST00000550655 ACP2P11117 423 aa16.15■□□□□ 0.18
CS-219ENST00000550655 DDX5P17844 614 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
CS-219ENST00000550655 PRPS1L1P21108 318 aa16.15■□□□□ 0.18
CS-219ENST00000550655 EVI2BP34910 448 aa16.15■□□□□ 0.18
CS-219ENST00000550655 SLC18A1P54219 525 aa16.15■□□□□ 0.18
CS-219ENST00000550655 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
CS-219ENST00000550655 CACNA1DQ01668 2161 aa16.15■□□□□ 0.18
CS-219ENST00000550655 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
CS-219ENST00000550655 TOMM20Q15388 145 aa16.15■□□□□ 0.18
CS-219ENST00000550655 DECR1Q16698 335 aa16.15■□□□□ 0.18
CS-219ENST00000550655 HHATQ5VTY9 493 aa16.15■□□□□ 0.18
CS-219ENST00000550655 VASNQ6EMK4 673 aa16.15■□□□□ 0.18
CS-219ENST00000550655 MFSD12Q6NUT3 480 aa16.15■□□□□ 0.18
CS-219ENST00000550655 ACAD11Q709F0 780 aa16.15■□□□□ 0.18
CS-219ENST00000550655 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
CS-219ENST00000550655 PLCZ1Q86YW0 608 aa16.15■□□□□ 0.18
CS-219ENST00000550655 ULK2Q8IYT8 1036 aa16.15■□□□□ 0.18
CS-219ENST00000550655 PIK3R3Q92569 461 aa16.15■□□□□ 0.18
CS-219ENST00000550655 RND1Q92730 232 aa16.15■□□□□ 0.18
CS-219ENST00000550655 COQ8BQ96D53 544 aa16.15■□□□□ 0.18
CS-219ENST00000550655 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
CS-219ENST00000550655 TIMP4Q99727 224 aa16.15■□□□□ 0.18
CS-219ENST00000550655 UGT2B28Q9BY64 529 aa16.15■□□□□ 0.18
CS-219ENST00000550655 PRDM14Q9GZV8 571 aa16.15■□□□□ 0.18
CS-219ENST00000550655 CHST11Q9NPF2 352 aa16.15■□□□□ 0.18
CS-219ENST00000550655 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
CS-219ENST00000550655 FBXL2Q9UKC9 423 aa16.15■□□□□ 0.18
CS-219ENST00000550655 ABCG2Q9UNQ0 655 aa16.15■□□□□ 0.18
CS-219ENST00000550655 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
CS-219ENST00000550655 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
CS-219ENST00000550655 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa16.14■□□□□ 0.17
CS-219ENST00000550655 EMC8O43402 210 aa16.14■□□□□ 0.17
CS-219ENST00000550655 CBR3O75828 277 aa16.14■□□□□ 0.17
CS-219ENST00000550655 GABRA1P14867 456 aa16.14■□□□□ 0.17
CS-219ENST00000550655 BMP7P18075 431 aa16.14■□□□□ 0.17
CS-219ENST00000550655 CHRNB4P30926 498 aa16.14■□□□□ 0.17
CS-219ENST00000550655 GABRA3P34903 492 aa16.14■□□□□ 0.17
CS-219ENST00000550655 ADH7P40394 386 aa16.14■□□□□ 0.17
CS-219ENST00000550655 PRKAG1P54619 331 aa16.14■□□□□ 0.17
CS-219ENST00000550655 DIO3P55073 304 aa16.14■□□□□ 0.17
CS-219ENST00000550655 CASP8Q14790 479 aa16.14■□□□□ 0.17
CS-219ENST00000550655 CPTPQ5TA50 214 aa16.14■□□□□ 0.17
CS-219ENST00000550655 SZRD1Q7Z422 152 aa16.14■□□□□ 0.17
CS-219ENST00000550655 CAMKMTQ7Z624 323 aa16.14■□□□□ 0.17
CS-219ENST00000550655 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
CS-219ENST00000550655 KIRREL3Q8IZU9 778 aa16.14■□□□□ 0.17
CS-219ENST00000550655 CDRT4Q8N9R6 151 aa16.14■□□□□ 0.17
CS-219ENST00000550655 CEP70Q8NHQ1 597 aa16.14■□□□□ 0.17
CS-219ENST00000550655 PSMA8Q8TAA3 256 aa16.14■□□□□ 0.17
CS-219ENST00000550655 FBXO30Q8TB52 745 aa16.14■□□□□ 0.17
CS-219ENST00000550655 MGARPQ8TDB4 240 aa16.14■□□□□ 0.17
CS-219ENST00000550655 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa16.14■□□□□ 0.17
CS-219ENST00000550655 ASB5Q8WWX0 329 aa16.14■□□□□ 0.17
CS-219ENST00000550655 MARVELD3Q96A59 401 aa16.14■□□□□ 0.17
CS-219ENST00000550655 RTN4RQ9BZR6 473 aa16.14■□□□□ 0.17
CS-219ENST00000550655 C3orf14Q9HBI5 128 aa16.14■□□□□ 0.17
CS-219ENST00000550655 ATAD3AQ9NVI7 634 aa16.14■□□□□ 0.17
CS-219ENST00000550655 PNPOQ9NVS9 261 aa16.14■□□□□ 0.17
CS-219ENST00000550655 TEX15Q9BXT5 2789 aa16.14■□□□□ 0.17
CS-219ENST00000550655 A0A0G2JNJ9 132 aa16.13■□□□□ 0.17
CS-219ENST00000550655 A0A1W2PRB8 838 aa16.13■□□□□ 0.17
CS-219ENST00000550655 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
CS-219ENST00000550655 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
CS-219ENST00000550655 SCO2O43819 266 aa16.13■□□□□ 0.17
CS-219ENST00000550655 SNNO75324 88 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
CS-219ENST00000550655 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
CS-219ENST00000550655 CLDN8P56748 225 aa16.13■□□□□ 0.17
CS-219ENST00000550655 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
CS-219ENST00000550655 OR5M10Q6IEU7 315 aa16.13■□□□□ 0.17
CS-219ENST00000550655 SEM1Q6ZVN7 128 aa16.13■□□□□ 0.17
CS-219ENST00000550655 FADS6Q8N9I5 356 aa16.13■□□□□ 0.17
CS-219ENST00000550655 SLC16A11Q8NCK7 471 aa16.13■□□□□ 0.17
CS-219ENST00000550655 GPR151Q8TDV0 419 aa16.13■□□□□ 0.17
CS-219ENST00000550655 OR5P2Q8WZ92 322 aa16.13■□□□□ 0.17
CS-219ENST00000550655 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
CS-219ENST00000550655 C16orf58Q96GQ5 468 aa16.13■□□□□ 0.17
CS-219ENST00000550655 NUF2Q9BZD4 464 aa16.13■□□□□ 0.17
CS-219ENST00000550655 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
CS-219ENST00000550655 CXorf36Q9H7Y0 433 aa16.13■□□□□ 0.17
CS-219ENST00000550655 MEAF6Q9HAF1 191 aa16.13■□□□□ 0.17
CS-219ENST00000550655 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
CS-219ENST00000550655 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
CS-219ENST00000550655 Q9UFV3 132 aa16.13■□□□□ 0.17
CS-219ENST00000550655 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
CS-219ENST00000550655 FBN2P35556 2912 aa16.12■□□□□ 0.17
CS-219ENST00000550655 DOCK7Q96N67 2140 aa16.12■□□□□ 0.17
CS-219ENST00000550655 KCNH1O95259 989 aa16.12■□□□□ 0.17
CS-219ENST00000550655 C6orf47O95873 294 aa16.12■□□□□ 0.17
CS-219ENST00000550655 PRF1P14222 555 aa16.12■□□□□ 0.17
CS-219ENST00000550655 SRD5A2P31213 254 aa16.12■□□□□ 0.17
CS-219ENST00000550655 PTGER4P35408 488 aa16.12■□□□□ 0.17
CS-219ENST00000550655 KIR3DL1P43629 444 aa16.12■□□□□ 0.17
CS-219ENST00000550655 RFX3P48380 749 aa16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms