RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 PRKAG1P54619 331 aa5.13□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 FOXA1P55317 472 aa5.13□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 RAE1P78406 368 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 HPCAP84074 193 aa5.13□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 OCRLQ01968 901 aa5.13□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 FOXO1Q12778 655 aa5.13□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 DUSP8Q13202 625 aa5.13□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 GAB1Q13480 694 aa5.13□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 GNA13Q14344 377 aa5.13□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 NHSL2Q5HYW2 709 aa5.13□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 C1orf185Q5T7R7 199 aa5.13□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa5.13□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 IL23RQ5VWK5 629 aa5.13□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa5.13□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 OR2A2Q6IF42 318 aa5.13□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM111BQ6SJ93 734 aa5.13□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa5.13□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM64Q6YI46 380 aa5.13□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa5.13□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa5.13□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF227Q86WZ6 799 aa5.13□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 SHISA5Q8N114 240 aa5.13□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 MEIOBQ8N635 442 aa5.13□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 LRRN4CLQ8ND94 238 aa5.13□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 NUP43Q8NFH3 380 aa5.13□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 OR7G2Q8NG99 324 aa5.13□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 LILRB4Q8NHJ6 448 aa5.13□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP5.13□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 ZPLD1Q8TCW7 415 aa5.13□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 SFXN5Q8TD22 340 aa5.13□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 ADAMTS15Q8TE58 950 aa5.13□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 DYDC1Q8WWB3 177 aa5.13□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 OIT3Q8WWZ8 545 aa5.13□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 OR5P2Q8WZ92 322 aa5.13□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC9A6Q92581 669 aa5.13□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 JADE3Q92613 823 aa5.13□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 TMBIM1Q969X1 311 aa5.13□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 MARVELD3Q96A59 401 aa5.13□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 VSTM2LQ96N03 204 aa5.13□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 TSSK3Q96PN8 268 aa5.13□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 STACQ99469 402 aa5.13□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 TM9SF2Q99805 663 aa5.13□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 SPOCK3Q9BQ16 436 aa5.13□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 DPY30Q9C005 99 aa5.13□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 GLIPR2Q9H4G4 154 aa5.13□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 ARMC7Q9H6L4 198 aa5.13□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 TIGARQ9NQ88 270 aa5.13□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 DUSP22Q9NRW4 184 aa5.13□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 EXD2Q9NVH0 621 aa5.13□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 TAS2R10Q9NYW0 307 aa5.13□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC17A7Q9P2U7 560 aa5.13□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 HEY2Q9UBP5 337 aa5.13□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 ATP6V1HQ9UI12 483 aa5.13□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 PRDM4Q9UKN5 801 aa5.13□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 C15orf41Q9Y2V0 281 aa5.13□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 FN1P02751 2386 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 PKDREJQ9NTG1 2253 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 WDR91A4D1P6 747 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 H0Y3Z8 333 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 UPK1AO00322 258 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 GNB5O14775 395 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 NDUFB5O43674 189 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 LRATO95237 230 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 GOSR1O95249 250 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 IL33O95760 270 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 EPPINO95925 133 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 IL18BPO95998 194 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 CLPSP04118 112 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 CRHP06850 196 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 NGFRP08138 427 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 CT45A8P0DMV1 189 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 CT45A9P0DMV2 189 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 UQCRBP14927 111 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 CHN1P15882 459 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 SDC1P18827 310 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 DPP4P27487 766 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 GABRA3P34903 492 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 EIF1P41567 113 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 ETV4P43268 484 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 MAGEA8P43361 318 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 KIR3DL1P43629 444 aa5.12□□□□□ -1.59
CLSTN3-215ENST00000544584 RFX3P48380 749 aa5.12□□□□□ -1.59
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