RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514178.5

PGGT1B-205, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PGGT1B, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-205ENST00000514178 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 LINC00242Q5T6M2 205 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 ATF7IP2Q5U623 682 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 SLX4IPQ5VYV7 408 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 LANCL3Q6ZV70 420 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 PRSS48Q7RTY5 328 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 ANKRD37Q7Z713 158 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 RPAINQ86UA6 219 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 LRRTM1Q86UE6 522 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 ANKFN1Q8N957 763 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 Q8NBF4 154 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 TADA1Q96BN2 335 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 NTNG2Q96CW9 530 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 MOCOSQ96EN8 888 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 DNAJA3Q96EY1 480 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 NFKBIZQ9BYH8 718 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 BARHL1Q9BZE3 327 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 SPATA2Q9UM82 520 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 CLEC4AQ9UMR7 237 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 AUP1Q9Y679 476 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 FER1L5A0AVI2 2057 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 SNNO75324 88 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 PPP2R1BP30154 601 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC1A4P43007 532 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF33BQ06732 778 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 LY6DQ14210 128 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 PDK3Q15120 406 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 CCL14Q16627 93 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 KIAA1328Q86T90 577 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 SUMF1Q8NBK3 374 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 ZBTB18Q99592 522 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 OMDQ99983 421 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM121Q9BTD3 319 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 SCRT2Q9NQ03 307 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 NUDT4Q9NZJ9 180 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 CPQQ9Y646 472 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 SCRIBQ14160 1630 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 STX7O15400 261 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 PPIHO43447 177 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 STX11O75558 287 aa6.31□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 NUDT14O95848 222 aa6.31□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 TPM2P07951 284 aa6.31□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 HCKP08631 526 aa6.31□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 HSD17B1P14061 328 aa6.31□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 UGT1A4P22310 534 aa6.31□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 ATP4BP51164 291 aa6.31□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 RIDAP52758 137 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 PLA2G16P53816 162 aa6.31□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM219BQ5XKK7 198 aa6.31□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 SEL1L3Q68CR1 1132 aa6.31□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM17Q86X19 198 aa6.31□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 RNF130Q86XS8 419 aa6.31□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF683Q8IZ20 524 aa6.31□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP6.31□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 CNDP1Q96KN2 507 aa6.31□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC30A2Q9BRI3 323 aa6.31□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 TCHPQ9BT92 498 aa6.31□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 MLXQ9UH92 298 aa6.31□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 ASIC3Q9UHC3 531 aa6.31□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 ANAPC7Q9UJX3 599 aa6.31□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 NESP48681 1621 aa6.31□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 C11orf98E9PRG8 122 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 EFNA2O43921 213 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 B3GAT3O94766 335 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 IL1BP01584 269 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 IGHG3P01860 377 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 IGF1P05019 195 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 WNT2P09544 360 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 CALB2P22676 271 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 SPRP35270 261 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 MFAP2P55001 183 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 RPS6P62753 249 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 TNFRSF17Q02223 184 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 ZMYND11Q15326 602 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 CCDC183Q5T5S1 534 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 CYS1Q717R9 158 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 LRRC43Q8N309 656 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 OR13C2Q8NGS9 318 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM3CQ92520 227 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 MYLPFQ96A32 169 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC41A3Q96GZ6 507 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 FEM1AQ9BSK4 669 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 CCDC28BQ9BUN5 200 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 CAPS2Q9BXY5 557 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 APMAPQ9HDC9 416 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-205ENST00000514178 WWOXQ9NZC7 414 aa6.3□□□□□ -1.4
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