RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505700.1

HOXC-AS1-201, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS1, Length 548 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZZZ3Q8IYH5 903 aa21.18■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PPCDCQ96CD2 204 aa21.18■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MECRQ9BV79 373 aa21.18■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 REEP4Q9H6H4 257 aa21.18■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SDHAF3Q9NRP4 125 aa21.18■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SH3BP4Q9P0V3 963 aa21.18■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa21.18■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRAF6Q9Y4K3 522 aa21.18■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DOCK7Q96N67 2140 aa21.17■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NPHS1O60500 1241 aa21.17■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PSMG1O95456 288 aa21.17■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FGF4P08620 206 aa21.17■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SDC1P18827 310 aa21.17■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GABRA3P34903 492 aa21.17■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OPRM1P35372 400 aa21.17■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PEX19P40855 299 aa21.17■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CLK3P49761 638 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GFRA1P56159 465 aa21.17■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RNF165Q6ZSG1 346 aa21.17■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C9orf106Q8NAJ2 232 aa21.17■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CLHC1Q8NHS4 586 aa21.17■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZFP28Q8NHY6 868 aa21.17■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RNF138Q8WVD3 245 aa21.17■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SH3GL2Q99962 352 aa21.17■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DSN1Q9H410 356 aa21.17■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C3orf14Q9HBI5 128 aa21.17■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EQTNQ9NQ60 294 aa21.17■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LGALS13Q9UHV8 139 aa21.17■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C17orf51A8MQB3 221 aa21.16■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMEM233B4DJY2 109 aa21.16■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FADS1O60427 444 aa21.16■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IL33O95760 270 aa21.16■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PRPS2P11908 318 aa21.16■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PRKAG1P54619 331 aa21.16■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MANFP55145 182 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 STX5Q13190 355 aa21.16■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 AGR3Q8TD06 166 aa21.16■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TCP10LQ8TDR4 215 aa21.16■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TWIST2Q8WVJ9 160 aa21.16■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FCRL1Q96LA6 429 aa21.16■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TM9SF2Q99805 663 aa21.16■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FLRT3Q9NZU0 649 aa21.16■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ABCG2Q9UNQ0 655 aa21.16■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMED5Q9Y3A6 229 aa21.16■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TTC36A6NLP5 189 aa21.15■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa21.15■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LSM1O15116 133 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZIC3O60481 467 aa21.15■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IFI6P09912 130 aa21.15■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CHMP24386 653 aa21.15■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LHX2P50458 406 aa21.15■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa21.15■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF385BQ569K4 471 aa21.15■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa21.15■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SZRD1Q7Z422 152 aa21.15■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CEP70Q8NHQ1 597 aa21.15■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GPR151Q8TDV0 419 aa21.15■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CRIM1Q9NZV1 1036 aa21.15■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MED11Q9P086 117 aa21.15■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SPG11Q96JI7 2443 aa21.14■□□□□ 0.97
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CLCA1A8K7I4 914 aa21.14■□□□□ 0.97
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PIP5K1BO14986 540 aa21.14■□□□□ 0.97
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TBX19O60806 448 aa21.14■□□□□ 0.97
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KCNH1O95259 989 aa21.14■□□□□ 0.97
HOXC-AS1-201ENST00000505700 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ASMTP46597 345 aa21.14■□□□□ 0.97
HOXC-AS1-201ENST00000505700 UGT3A2Q3SY77 523 aa21.14■□□□□ 0.97
HOXC-AS1-201ENST00000505700 VPS26BQ4G0F5 336 aa21.14■□□□□ 0.97
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EMBQ6PCB8 327 aa21.14■□□□□ 0.97
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PLXDC2Q6UX71 529 aa21.14■□□□□ 0.97
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CHMP1BQ7LBR1 199 aa21.14■□□□□ 0.97
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MARCH3Q86UD3 253 aa21.14■□□□□ 0.97
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OR2M3Q8NG83 312 aa21.14■□□□□ 0.97
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DUSP19Q8WTR2 217 aa21.14■□□□□ 0.97
HOXC-AS1-201ENST00000505700 WNT2BQ93097 391 aa21.14■□□□□ 0.97
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GXYLT2A0PJZ3 443 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXC-AS1-201ENST00000505700 B4DXG7 233 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IL18BPO95998 194 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BCKDHAP12694 445 aa21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms