RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498678.5

HOXB3-212, Transcript of homeobox B3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 2,196 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-212ENST00000498678 ZNF619Q8N2I2 560 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 ALPK1Q96QP1 1244 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 DTX4Q9Y2E6 619 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 R4GN57 208 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 PRAMEF2O60811 474 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 CLIP4Q8N3C7 705 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 SLC38A9Q8NBW4 561 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 PSD2Q9BQI7 771 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 OR10A5Q9H207 317 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 RIBC2Q9H4K1 309 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 SLC22A11Q9NSA0 550 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 RARRES3Q9UL19 164 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 MYRFQ9Y2G1 1151 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 SEC16AO15027 2179 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 C17orf105B2RV13 164 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 ANXA8P13928 327 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 PLA2G2CQ5R387 149 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 PHF19Q5T6S3 580 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 ZNF615Q8N8J6 731 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 GRIP2Q9C0E4 1043 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 SLC13A4Q9UKG4 626 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 D6RAR5 112 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 CCNB2O95067 398 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 KCNK2O95069 426 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 CLPSP04118 112 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 H1F0P07305 194 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 GRK6P43250 576 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 MAPK14Q16539 360 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 COX15Q7KZN9 410 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 TAGAPQ8N103 731 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 ZNF786Q8N393 782 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 OR9Q2Q8NGE9 314 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 C16orf52Q8NHV5 167 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 FRYLO94915 3013 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 TTC28Q96AY4 2481 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 KIAA0513O60268 411 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 BRINP1O60477 761 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 IL7RP16871 459 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 GSTT1P30711 240 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 KCNE5Q9UJ90 142 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 LNP1A1A4G5 178 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 CLDN24A6NM45 220 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 FRS3O43559 492 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 UGT2B11O75310 529 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 THBS1P07996 1170 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 LAPTM4BQ86VI4 370 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 OR4N2Q8NGD1 307 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 SLC35B4Q969S0 331 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 CTSFQ9UBX1 484 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 FER1L5A0AVI2 2057 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 TPST2O60704 377 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 SCRG1O75711 98 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 CYP4B1P13584 511 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 NPSR1Q6W5P4 371 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 ZNF836Q6ZNA1 936 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 THAP5Q7Z6K1 395 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 ZAR1Q86SH2 424 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 TMEM151BQ8IW70 566 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 PMM1Q92871 262 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 PRRC1Q96M27 445 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 FUZQ9BT04 418 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 POLE3Q9NRF9 147 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 OCIAD1Q9NX40 245 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 KLHL28Q9NXS3 571 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 ARRDC5A6NEK1 342 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 EPHA2P29317 976 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 CLK3P49761 638 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
HOXB3-212ENST00000498678 SMIM11AP58511 58 aa24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms