RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492485.5

TRIOBP-211, Transcript of TRIO and F-actin binding protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TRIOBP, Length 3,948 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBP-211ENST00000492485 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 FLRT2O43155 660 aa11.66□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 PRNPP04156 253 aa11.66□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 C1SP09871 688 aa11.66□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 SLC35G6P0C7Q6 338 aa11.66□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 ZNF806P0C7X5 589 aa11.66□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 PVRP15151 417 aa11.66□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 C4BPBP20851 252 aa11.66□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 MTA1Q13330 715 aa11.66□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 ZNF234Q14588 700 aa11.66□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 XKR4Q5GH76 650 aa11.66□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 NUDT18Q6ZVK8 323 aa11.66□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 KRT77Q7Z794 578 aa11.66□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 ARL14Q8N4G2 192 aa11.66□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 PROKR2Q8NFJ6 384 aa11.66□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 OR2T33Q8NG76 320 aa11.66□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 OR52E4Q8NGH9 312 aa11.66□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 FANK1Q8TC84 345 aa11.66□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 DMRT3Q9NQL9 472 aa11.66□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 ACER3Q9NUN7 267 aa11.66□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 OR2W5A6NFC9 320 aa11.65□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 DSCR3O14972 297 aa11.65□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 DNAJB5O75953 348 aa11.65□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 IFNA7P01567 189 aa11.65□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 IFNGP01579 166 aa11.65□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 OPN1LWP04000 364 aa11.65□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 TFPIP10646 304 aa11.65□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 ARSBP15848 533 aa11.65□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 SEC23BQ15437 767 aa11.65□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 FRMD1Q8N878 549 aa11.65□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 MAP6Q96JE9 813 aa11.65□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 ZSWIM3Q96MP5 696 aa11.65□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 BCL2L14Q9BZR8 327 aa11.65□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 KLHL31Q9H511 634 aa11.65□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 FKBP14Q9NWM8 211 aa11.65□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 FLVCR2Q9UPI3 526 aa11.65□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 GXYLT2A0PJZ3 443 aa11.65□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 FAAHO00519 579 aa11.65□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 TGM5O43548 720 aa11.65□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 H2AFB2P0C5Z0 115 aa11.65□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 MMP11P24347 488 aa11.65□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 BMP8BP34820 402 aa11.65□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 PCGF2P35227 344 aa11.65□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 VEZF1Q14119 521 aa11.65□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 GNA13Q14344 377 aa11.65□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 TRAM2Q15035 370 aa11.65□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa11.65□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 TRIM46Q7Z4K8 759 aa11.65□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa11.65□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 TAF8Q7Z7C8 310 aa11.65□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa11.65□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 ST8SIA2Q92186 375 aa11.65□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 ZG16BQ96DA0 208 aa11.65□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 ALG8Q9BVK2 526 aa11.65□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 SEMA4CQ9C0C4 833 aa11.65□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 BTBD1Q9H0C5 482 aa11.65□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa11.65□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 SH2B3Q9UQQ2 575 aa11.65□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 NHSQ6T4R5 1651 aa11.65□□□□□ -0.55
TRIOBP-211ENST00000492485 CENPBD1B2RD01 187 aa11.65□□□□□ -0.55
TRIOBP-211ENST00000492485 ADAP00813 363 aa11.65□□□□□ -0.55
TRIOBP-211ENST00000492485 IGLV3-25P01717 112 aa11.65□□□□□ -0.55
TRIOBP-211ENST00000492485 CBSLP0DN79 551 aa11.65□□□□□ -0.55
TRIOBP-211ENST00000492485 GPX2P18283 190 aa11.65□□□□□ -0.55
TRIOBP-211ENST00000492485 CD22P20273 847 aa11.65□□□□□ -0.55
TRIOBP-211ENST00000492485 CBSP35520 551 aa11.65□□□□□ -0.55
TRIOBP-211ENST00000492485 OR3A3P47888 321 aa11.65□□□□□ -0.55
TRIOBP-211ENST00000492485 FAPQ12884 760 aa11.65□□□□□ -0.55
TRIOBP-211ENST00000492485 FADDQ13158 208 aa11.65□□□□□ -0.55
TRIOBP-211ENST00000492485 SP140Q13342 867 aa11.65□□□□□ -0.55
TRIOBP-211ENST00000492485 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP11.65□□□□□ -0.55
TRIOBP-211ENST00000492485 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.55
TRIOBP-211ENST00000492485 CDK10Q15131 360 aa11.65□□□□□ -0.55
TRIOBP-211ENST00000492485 SPATS1Q496A3 300 aa11.65□□□□□ -0.55
TRIOBP-211ENST00000492485 TCEAL5Q5H9L2 206 aa11.65□□□□□ -0.55
TRIOBP-211ENST00000492485 GAREM2Q75VX8 874 aa11.65□□□□□ -0.55
TRIOBP-211ENST00000492485 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.55
TRIOBP-211ENST00000492485 TXNDC15Q96J42 360 aa11.65□□□□□ -0.55
TRIOBP-211ENST00000492485 DHRS1Q96LJ7 313 aa11.65□□□□□ -0.55
TRIOBP-211ENST00000492485 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.55
TRIOBP-211ENST00000492485 FN3KQ9H479 309 aa11.65□□□□□ -0.55
TRIOBP-211ENST00000492485 EXO5Q9H790 373 aa11.65□□□□□ -0.55
TRIOBP-211ENST00000492485 TMEM185BQ9H7F4 350 aa11.65□□□□□ -0.55
TRIOBP-211ENST00000492485 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.55
TRIOBP-211ENST00000492485 GSKIPQ9P0R6 139 aa11.65□□□□□ -0.55
TRIOBP-211ENST00000492485 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.55
TRIOBP-211ENST00000492485 RCE1Q9Y256 329 aa11.65□□□□□ -0.55
TRIOBP-211ENST00000492485 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
TRIOBP-211ENST00000492485 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
TRIOBP-211ENST00000492485 ANTXRLA6NF34 631 aa11.64□□□□□ -0.55
TRIOBP-211ENST00000492485 HMX3A6NHT5 357 aa11.64□□□□□ -0.55
TRIOBP-211ENST00000492485 MCIDASD6RGH6 385 aa11.64□□□□□ -0.55
TRIOBP-211ENST00000492485 H3BNC9 293 aa11.64□□□□□ -0.55
TRIOBP-211ENST00000492485 H7C1C5 153 aa11.64□□□□□ -0.55
TRIOBP-211ENST00000492485 LCN6P62502 163 aa11.64□□□□□ -0.55
TRIOBP-211ENST00000492485 DEFB103AP81534 67 aa11.64□□□□□ -0.55
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