RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490653.1

PRPF4B-208, Transcript of pre-mRNA processing factor 4B, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF4B, Length 581 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4B-208ENST00000490653 MECRQ9BV79 373 aa6.66□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 FAIM2Q9BWQ8 316 aa6.66□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 UGT2B28Q9BY64 529 aa6.66□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 TUBB1Q9H4B7 451 aa6.66□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 GLIPR2Q9H4G4 154 aa6.66□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 L2HGDHQ9H9P8 463 aa6.66□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 FOLH1BQ9HBA9 442 aa6.66□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 KCNJ16Q9NPI9 418 aa6.66□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 SERHLQ9NQF3 203 aa6.66□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa6.66□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 OXSMQ9NWU1 459 aa6.66□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 NMRK1Q9NWW6 199 aa6.66□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 SLC17A7Q9P2U7 560 aa6.66□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 FETUBQ9UGM5 382 aa6.66□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP6.66□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa6.66□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 FBXL2Q9UKC9 423 aa6.66□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 PSME2Q9UL46 239 aa6.66□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 GRID1Q9ULK0 1009 aa6.66□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 MAPRE3Q9UPY8 281 aa6.66□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 C15orf41Q9Y2V0 281 aa6.66□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa6.66□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 V9GYY5 206 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 GXYLT2A0PJZ3 443 aa6.65□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 GOLGA6L10A6NI86 522 aa6.65□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 CAPN14A8MX76 684 aa6.65□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 TMEM233B4DJY2 109 aa6.65□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 COPEO14579 308 aa6.65□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 TO15178 435 aa6.65□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 EPPINO95925 133 aa6.65□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 ENO1P06733 434 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 CHRNGP07510 517 aa6.65□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 LINC00032P0C843 101 aa6.65□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 DRD2P14416 443 aa6.65□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 NAGAP17050 411 aa6.65□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 KRT4P19013 534 aa6.65□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 ALDH3A1P30838 453 aa6.65□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 MASP1P48740 699 aa6.65□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF136P52737 540 aa6.65□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 GAS1P54826 345 aa6.65□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 NRG3P56975 720 aa6.65□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 VSNL1P62760 191 aa6.65□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 PSG6Q00889 435 aa6.65□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 SRYQ05066 204 aa6.65□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 PLCXD2Q0VAA5 305 aa6.65□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 FOXF2Q12947 444 aa6.65□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 GAB1Q13480 694 aa6.65□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 PCLAFQ15004 111 aa6.65□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 SH2D4BQ5SQS7 431 aa6.65□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 CES4AQ5XG92 561 aa6.65□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 NOXRED1Q6NXP6 359 aa6.65□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 GALNT18Q6P9A2 607 aa6.65□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 FRMD7Q6ZUT3 714 aa6.65□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 LIX1Q8N485 282 aa6.65□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 CCDC63Q8NA47 563 aa6.65□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 OR1J4Q8NGS1 313 aa6.65□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 CLHC1Q8NHS4 586 aa6.65□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF675Q8TD23 568 aa6.65□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 HSPBAP1Q96EW2 488 aa6.65□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF597Q96LX8 424 aa6.65□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 VSTM2LQ96N03 204 aa6.65□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 KLHDC3Q9BQ90 382 aa6.65□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 LIME1Q9H400 295 aa6.65□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 METTL7AQ9H8H3 244 aa6.65□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 SIRT5Q9NXA8 310 aa6.65□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 QPCTLQ9NXS2 382 aa6.65□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 CAMK2AQ9UQM7 478 aa6.65□□□□□ -1.34
PRPF4B-208ENST00000490653 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
PRPF4B-208ENST00000490653 MED12LQ86YW9 2145 aa6.64□□□□□ -1.35
PRPF4B-208ENST00000490653 ACANP16112 2415 aa6.64□□□□□ -1.35
PRPF4B-208ENST00000490653 PRAMEF25A6NGN4 478 aa6.64□□□□□ -1.35
PRPF4B-208ENST00000490653 FRG2CA6NGY1 282 aa6.64□□□□□ -1.35
PRPF4B-208ENST00000490653 AHRRA9YTQ3 701 aa6.64□□□□□ -1.35
PRPF4B-208ENST00000490653 H0YC42 278 aa6.64□□□□□ -1.35
PRPF4B-208ENST00000490653 UPK1AO00322 258 aa6.64□□□□□ -1.35
PRPF4B-208ENST00000490653 AKAP10O43572 662 aa6.64□□□□□ -1.35
PRPF4B-208ENST00000490653 ZIC3O60481 467 aa6.64□□□□□ -1.35
PRPF4B-208ENST00000490653 PLOD3O60568 738 aa6.64□□□□□ -1.35
PRPF4B-208ENST00000490653 WDR1O75083 606 aa6.64□□□□□ -1.35
PRPF4B-208ENST00000490653 SEC22BO75396 215 aa6.64□□□□□ -1.35
PRPF4B-208ENST00000490653 ERN1O75460 977 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PRPF4B-208ENST00000490653 SNX4O95219 450 aa6.64□□□□□ -1.35
PRPF4B-208ENST00000490653 IGKV1D-16P01601 117 aa6.64□□□□□ -1.35
PRPF4B-208ENST00000490653 CYP4B1P13584 511 aa6.64□□□□□ -1.35
PRPF4B-208ENST00000490653 DDCP20711 480 aa6.64□□□□□ -1.35
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