RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247	SERPIND1	P05546	499 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	FES	P07332	822 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF888	P0CJ79	500 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	HNRNPCL4	P0DMR1	293 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	ANXA8	P13928	327 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	CTSE	P14091	401 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	IL9	P15248	144 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	CBL	P22681	906 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	CRHBP	P24387	322 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	MAP3K8	P41279	467 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	STAT5A	P42229	794 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	CAPZB	P47756	277 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	ALDH9A1	P49189	494 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	NCBP2	P52298	156 aa	Known RBP eCLIP	5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	MAPK10	P53779	464 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	LIM2	P55344	173 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	NUP107	P57740	925 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	RAB8A	P61006	207 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	ARF3	P61204	181 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	HNRNPK	P61978	463 aa	Known RBP eCLIP	5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	BTN3A2	P78410	334 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	IGLV3-21	P80748	117 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	DUSP2	Q05923	314 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	CD47	Q08722	323 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	FUT5	Q11128	374 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	HSPB3	Q12988	150 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	RUNX2	Q13950	521 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM53B	Q14153	422 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	DUSP7	Q16829	419 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	MICA	Q29983	383 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	NADK2	Q4G0N4	442 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	FHL5	Q5TD97	284 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	RNF220	Q5VTB9	566 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	GARNL3	Q5VVW2	1013 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	C18orf63	Q68DL7	685 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	FRMPD2B	Q6IN97	320 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF770	Q6IQ21	691 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	LAIR2	Q6ISS4	152 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	CDC73	Q6P1J9	531 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	ZCCHC12	Q6PEW1	402 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	TTC33	Q6PID6	262 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF773	Q6PK81	442 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	DHRS4L2	Q6PKH6	230 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM92B	Q6ZTR7	304 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	GALNT10	Q86SR1	603 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	TRIM73	Q86UV7	250 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	GKN2	Q86XP6	184 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	CMIP	Q8IY22	773 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	OR4N4	Q8N0Y3	316 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	LRRC25	Q8N386	305 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	ARL14	Q8N4G2	192 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	DNAJC22	Q8N4W6	341 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	SETD9	Q8NE22	299 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM46D	Q8NEK8	389 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF555	Q8NEP9	628 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	OR5AK3P	Q8NH89	298 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	PHF10	Q8WUB8	498 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	JPH3	Q8WXH2	748 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	NR4A3	Q92570	626 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	TANK	Q92844	425 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	UCN3	Q969E3	161 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	CTHRC1	Q96CG8	243 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	ELP4	Q96EB1	424 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF354B	Q96LW1	612 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	GUCD1	Q96NT3	240 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	TRNT1	Q96Q11	434 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF607	Q96SK3	696 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	DOK1	Q99704	481 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	TREX2	Q9BQ50	279 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	YIPF4	Q9BSR8	244 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	RSPO3	Q9BXY4	272 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	LDHAL6B	Q9BYZ2	381 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	OR51I1	Q9H343	314 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	ZMAT4	Q9H898	229 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	C3orf14	Q9HBI5	128 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	ZCCHC3	Q9NUD5	404 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	ACER3	Q9NUN7	267 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	CALML5	Q9NZT1	146 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	C5AR2	Q9P296	337 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	ENOPH1	Q9UHY7	261 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	BLOC1S6	Q9UL45	172 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	SATB2	Q9UPW6	733 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	KLHL20	Q9Y2M5	609 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	PCDHGA8	Q9Y5G5	932 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	ORC6	Q9Y5N6	252 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	SNX8	Q9Y5X2	465 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	CSNK1G3	Q9Y6M4	447 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF780B	Q9Y6R6	833 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	COMMD3-BMI1	R4GMX3	469 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	LRP4	O75096	1905 aa		5.18	□□□□□ -1.58

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