RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483538.1

POLR1A-207, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 4

Gene POLR1A, Length 593 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-207ENST00000483538 RFWD2Q8NHY2 731 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 SFXN5Q8TD22 340 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 DYDC1Q8WWB3 177 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 CDS1Q92903 461 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 RELTQ969Z4 430 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 CCDC115Q96NT0 180 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 GNRHR2Q96P88 292 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 KLHDC3Q9BQ90 382 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 OSBPL11Q9BXB4 747 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 ZNF385DQ9H6B1 395 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 SLC52A3Q9NQ40 469 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 TCF7L2Q9NQB0 619 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 CBLCQ9ULV8 474 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 MAPRE3Q9UPY8 281 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 OR10H1Q9Y4A9 318 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 WIF1Q9Y5W5 379 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 SNX8Q9Y5X2 465 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 MED12Q93074 2177 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 ACOT7O00154 380 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 GNB5O14775 395 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 LRRTM2O43300 516 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 REM1O75628 298 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 KCNK2O95069 426 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 SNX4O95219 450 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 TGDSO95455 350 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 HPNP05981 417 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 PGRP06401 933 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 IL12BP29460 328 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 SOAT1P35610 550 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 CCT3P49368 545 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 PSPHP78330 225 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 PRR5P85299 388 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 ADORA2A-AS1P86434 159 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 SNTA1Q13424 505 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 TP53BP2Q13625 1128 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 GSTA3Q16772 222 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 DPY19L1Q2PZI1 675 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 GRAMD1BQ3KR37 738 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 C4orf17Q53FE4 359 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 DCST1Q5T197 706 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 SAXO2Q658L1 398 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 TIGD3Q6B0B8 471 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 SLC30A6Q6NXT4 461 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 CDC73Q6P1J9 531 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 FIGNL1Q6PIW4 674 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 PAOXQ6QHF9 649 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 C3P1Q6ZMU1 363 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 OLIG3Q7RTU3 272 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 DOLPP1Q86YN1 238 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 FUNDC1Q8IVP5 155 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 RPRMLQ8N4K4 120 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 MARVELD2Q8N4S9 558 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 NATD1Q8N6N6 113 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 FADS6Q8N9I5 356 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 OR56A1Q8NGH5 318 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 OR5D16Q8NGK9 328 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 OR4A15Q8NGL6 344 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 OR4C3Q8NH37 302 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 CEP70Q8NHQ1 597 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 GPR151Q8TDV0 419 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 STON2Q8WXE9 905 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 SLC9A6Q92581 669 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 PHF12Q96QT6 1004 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 OR7D2Q96RA2 312 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 DMRTA2Q96SC8 542 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 PIGUQ9H490 435 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 METTL7AQ9H8H3 244 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 C3orf14Q9HBI5 128 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 Q9N2J8 555 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 DUSP22Q9NRW4 184 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 KLRF1Q9NZS2 232 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 ZIM2Q9NZV7 527 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 FBXL2Q9UKC9 423 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 SLC5A6Q9Y289 635 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa8.11□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa8.11□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 NPIPB9F8W1W9 429 aa8.11□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 AQP7O14520 342 aa8.11□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 UBDO15205 165 aa8.11□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 CFLARO15519 480 aa8.11□□□□□ -1.11
POLR1A-207ENST00000483538 SCO2O43819 266 aa8.11□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.5 ms