RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 PHC1P78364 1004 aa19.13■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa19.13■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 C3P1Q6ZMU1 363 aa19.13■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 SLC16A11Q8NCK7 471 aa19.13■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 OR1J4Q8NGS1 313 aa19.13■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 FBXO30Q8TB52 745 aa19.13■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 GPR151Q8TDV0 419 aa19.13■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 ACTRT2Q8TDY3 377 aa19.13■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 SLC9A6Q92581 669 aa19.13■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 TESCQ96BS2 214 aa19.13■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 TEX37Q96LM6 180 aa19.13■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 YIPF4Q9BSR8 244 aa19.13■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 SLC6A15Q9H2J7 730 aa19.13■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa19.13■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 ZNF446Q9NWS9 450 aa19.13■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 FLRT3Q9NZU0 649 aa19.13■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa19.13■□□□□ 0.65
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ACTB-211ENST00000480301 SNX8Q9Y5X2 465 aa19.13■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 GPR45Q9Y5Y3 372 aa19.13■□□□□ 0.65
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ACTB-211ENST00000480301 OR14I1A6ND48 311 aa19.12■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 FADS1O60427 444 aa19.12■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 TRPC1P48995 793 aa19.12■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 PRIM2P49643 509 aa19.12■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 NME5P56597 212 aa19.12■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 UFM1P61960 85 aa19.12■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 ADORA2A-AS1P86434 159 aa19.12■□□□□ 0.65
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ACTB-211ENST00000480301 GXYLT1Q4G148 440 aa19.12■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 MTFR2Q6P444 385 aa19.12■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 CLECL1Q8IZS7 167 aa19.12■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 OR56A1Q8NGH5 318 aa19.12■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 NEIL3Q8TAT5 605 aa19.12■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 DMRTA2Q96SC8 542 aa19.12■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 NEUROD4Q9HD90 331 aa19.12■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 GPATCH2Q9NW75 528 aa19.12■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 SPRR3Q9UBC9 169 aa19.12■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 WIF1Q9Y5W5 379 aa19.12■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 USH1CQ9Y6N9 552 aa19.12■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 COL12A1Q99715 3063 aa19.12■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 A1L4Q6 167 aa19.11■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 E9PLN8 166 aa19.11■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 BCKDKO14874 412 aa19.11■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 CFLARO15519 480 aa19.11■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 TRAPPC6AO75865 159 aa19.11■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 KCNH1O95259 989 aa19.11■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 CLDN1O95832 211 aa19.11■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 ALOX5P09917 674 aa19.11■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 IL12AP29459 219 aa19.11■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 KIR3DL1P43629 444 aa19.11■□□□□ 0.65
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ACTB-211ENST00000480301 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 SPANXN4Q5MJ08 99 aa19.11■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 NXNQ6DKJ4 435 aa19.11■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 FAM110BQ8TC76 370 aa19.11■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 SFXN5Q8TD22 340 aa19.11■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 OR52B2Q96RD2 323 aa19.11■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 VKORC1Q9BQB6 163 aa19.11■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 EXO5Q9H790 373 aa19.11■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 SERHLQ9NQF3 203 aa19.11■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 PNPLA3Q9NST1 481 aa19.11■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 GIN1Q9NXP7 522 aa19.11■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa19.1■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 C17orf51A8MQB3 221 aa19.1■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 B4DXG7 233 aa19.1■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 CBR3O75828 277 aa19.1■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 EVI2BP34910 448 aa19.1■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 TP53BP2Q13625 1128 aa19.1■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 SPDYE7PQ495Y7 208 aa19.1■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 EIPR1Q53HC9 387 aa19.1■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 ANXA8L1Q5VT79 327 aa19.1■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 EPGNQ6UW88 154 aa19.1■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 PLCZ1Q86YW0 608 aa19.1■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 OR5M9Q8NGP3 310 aa19.1■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 OR5AK3PQ8NH89 298 aa19.1■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 DYDC1Q8WWB3 177 aa19.1■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 CKAP2Q8WWK9 683 aa19.1■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 MOAP1Q96BY2 351 aa19.1■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 SARAFQ96BY9 339 aa19.1■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 PIGUQ9H490 435 aa19.1■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 DUSP22Q9NRW4 184 aa19.1■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 ABCG2Q9UNQ0 655 aa19.1■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 PCNX1Q96RV3 2341 aa19.09■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 E9PBE3 544 aa19.09■□□□□ 0.65
ACTB-211ENST00000480301 KCNK2O95069 426 aa19.09■□□□□ 0.65
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