RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473778.5

C9orf3-214, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf3, Length 2,396 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-214ENST00000473778 RAB8AP61006 207 aa10.25□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 RAB40BQ12829 278 aa10.25□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 FAM78AQ5JUQ0 283 aa10.25□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa10.25□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa10.25□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 ZFPM2Q8WW38 1151 aa10.25□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 FCRL4Q96PJ5 515 aa10.25□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 OR7D2Q96RA2 312 aa10.25□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 BBS4Q96RK4 519 aa10.25□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 HDHD5Q9BXW7 423 aa10.25□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 GIMAP4Q9NUV9 329 aa10.25□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 SPHK1Q9NYA1 384 aa10.25□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 COMMD3Q9UBI1 195 aa10.25□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 SPEF1Q9Y4P9 236 aa10.25□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa10.25□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa10.25□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 NR2F6P10588 404 aa10.25□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 WASP42768 502 aa10.25□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 SLC1A3P43003 542 aa10.25□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 AVPR1BP47901 424 aa10.25□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 SOX9P48436 509 aa10.25□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 CLDN2P57739 230 aa10.25□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 TAS2R41P59536 307 aa10.25□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 SCN1BQ07699 218 aa10.25□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 C19orf57Q0VDD7 668 aa10.25□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 SLC9A5Q14940 896 aa10.25□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 NDUFA9Q16795 377 aa10.25□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 MINDY4Q4G0A6 757 aa10.25□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 ZNF311Q5JNZ3 666 aa10.25□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa10.25□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa10.25□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 AGBL4Q5VU57 503 aa10.25□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 ABHD17CQ6PCB6 329 aa10.25□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 XKRXQ6PP77 449 aa10.25□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 PAMR1Q6UXH9 720 aa10.25□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 SLC36A4Q6YBV0 504 aa10.25□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 NR2C2APQ86WQ0 139 aa10.25□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 TRIM48Q8IWZ4 208 aa10.25□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 RDH10Q8IZV5 341 aa10.25□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 GALNT6Q8NCL4 622 aa10.25□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 KAT2AQ92830 837 aa10.25□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 TRIM63Q969Q1 353 aa10.25□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 GIMAP5Q96F15 307 aa10.25□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 CAMK1GQ96NX5 476 aa10.25□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 B3GNT4Q9C0J1 378 aa10.25□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 PCBD2Q9H0N5 130 aa10.25□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 STMN3Q9NZ72 180 aa10.25□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 SNX7Q9UNH6 387 aa10.25□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 CDC42EP2O14613 210 aa10.24□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 MID1O15344 667 aa10.24□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 HPGDSO60760 199 aa10.24□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 M6PRP20645 277 aa10.24□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 NTSP30990 170 aa10.24□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 GABRA5P31644 462 aa10.24□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 TCEA2Q15560 299 aa10.24□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 ZFP69Q49AA0 526 aa10.24□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 C2orf27AQ580R0 203 aa10.24□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 DDI2Q5TDH0 399 aa10.24□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 FAM111BQ6SJ93 734 aa10.24□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 TMEM64Q6YI46 380 aa10.24□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 TEX47Q8TBZ9 253 aa10.24□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 SLC7A6Q92536 515 aa10.24□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 ARSGQ96EG1 525 aa10.24□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 SNX18Q96RF0 628 aa10.24□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 ARHGDIGQ99819 225 aa10.24□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 SOSTQ9BQB4 213 aa10.24□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 MED18Q9BUE0 208 aa10.24□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 TMED9Q9BVK6 235 aa10.24□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 PINK1Q9BXM7 581 aa10.24□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 TEX101Q9BY14 249 aa10.24□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa10.24□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa10.24□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 FAM183AA6NL82 134 aa10.24□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 CASC3O15234 703 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 SURF4O15260 269 aa10.24□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 PCDH8O95206 1070 aa10.24□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 RPN2P04844 631 aa10.24□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 F3P13726 295 aa10.24□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 FUT1P19526 365 aa10.24□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 RAB28P51157 221 aa10.24□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 PDX1P52945 283 aa10.24□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 GALK2Q01415 458 aa10.24□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 TSPAN31Q12999 210 aa10.24□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 CDK10Q15131 360 aa10.24□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 IRF4Q15306 451 aa10.24□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 KLHL22Q53GT1 634 aa10.24□□□□□ -0.77
C9orf3-214ENST00000473778 PYDC2Q56P42 97 aa10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms