RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468852.2

MKNK1-208, Transcript of MAP kinase interacting serine/threonine kinase 1, human

TSL 3

Gene MKNK1, Length 584 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MKNK1-208	ENST00000468852	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	GXYLT2	A0PJZ3	443 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	GSTA4	O15217	222 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	CIB2	O75838	187 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	PDE5A	O76074	875 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	IL33	O95760	270 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	CELA2A	P08217	269 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	PRKAR1A	P10644	381 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	ETS2	P15036	469 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	TCN1	P20061	433 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	ATP6V1C1	P21283	382 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	KRT20	P35900	424 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	TMED10	P49755	219 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	PCBP3	P57721	371 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	MLF1	P58340	268 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	KCNJ2	P63252	427 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	MAPK11	Q15759	364 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	SYPL1	Q16563	259 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	GPAT3	Q53EU6	434 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	TCTN3	Q6NUS6	607 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	UNQ6494/PRO21346	Q6UXR6	183 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	BCORP1	Q8N888	145 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	MAL2	Q969L2	176 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	OTUB1	Q96FW1	271 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	ZNF354B	Q96LW1	612 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	TRIM15	Q9C019	465 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	SLC38A1	Q9H2H9	487 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	TEKT2	Q9UIF3	430 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	POMP	Q9Y244	141 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	WDR45	Q9Y484	360 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	PCDHGA10	Q9Y5H3	936 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	DSPP	Q9NZW4	1301 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	OR6C70	A6NIJ9	312 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	CXCR6	O00574	342 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	TSPAN2	O60636	221 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	PGM3	O95394	542 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	H6PD	O95479	791 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	NADK	O95544	446 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	IFNA14	P01570	189 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	CHRM4	P08173	479 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	ITGA3	P26006	1051 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	ABCD3	P28288	659 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	PNLIPRP2	P54317	469 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	POLE2	P56282	527 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	PLCXD2	Q0VAA5	305 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	EFR3A	Q14156	821 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	NNAT	Q16517	81 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	MEP1A	Q16819	746 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	MTX3	Q5HYI7	312 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	CRB2	Q5IJ48	1285 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	ATP1A1-AS1	Q5TC04	95 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	GLYAT	Q6IB77	296 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	LCN8	Q6JVE9	175 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	OPN5	Q6U736	354 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	KRT73	Q86Y46	540 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	ZNF619	Q8N2I2	560 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	ANKFN1	Q8N957	763 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	OR4N2	Q8NGD1	307 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	BRIX1	Q8TDN6	353 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	PSMF1	Q92530	271 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	DIO2	Q92813	273 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	CCDC124	Q96CT7	223 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	OMA1	Q96E52	524 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	RNF145	Q96MT1	663 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	ZNF607	Q96SK3	696 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	TREX2	Q9BQ50	279 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	HOXD1	Q9GZZ0	328 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	TRIM45	Q9H8W5	580 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	GMPR2	Q9P2T1	348 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	EGFL7	Q9UHF1	273 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	USP22	Q9UPT9	525 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MKNK1-208	ENST00000468852		A0A087WV48	116 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MKNK1-208	ENST00000468852	ARGFX	A6NJG6	315 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MKNK1-208	ENST00000468852	WWP2	O00308	870 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MKNK1-208	ENST00000468852	ACOT8	O14734	319 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MKNK1-208	ENST00000468852	ARPC2	O15144	300 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MKNK1-208	ENST00000468852	HS6ST1	O60243	411 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MKNK1-208	ENST00000468852	KIAA0513	O60268	411 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MKNK1-208	ENST00000468852	ITGA10	O75578	1167 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MKNK1-208	ENST00000468852	SERPINB7	O75635	380 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MKNK1-208	ENST00000468852	PPM1B	O75688	479 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MKNK1-208	ENST00000468852	IL12B	P29460	328 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MKNK1-208	ENST00000468852	KDELR2	P33947	212 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MKNK1-208	ENST00000468852	TLE3	Q04726	772 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MKNK1-208	ENST00000468852	TYW3	Q6IPR3	259 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
MKNK1-208	ENST00000468852	FIGNL1	Q6PIW4	674 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MKNK1-208	ENST00000468852	FRRS1	Q6ZNA5	592 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MKNK1-208	ENST00000468852	DHFR2	Q86XF0	187 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MKNK1-208	ENST00000468852	GPALPP1	Q8IXQ4	340 aa		13.58	□□□□□ -0.24

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