RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464454.1

CLK1-208, Transcript of CDC like kinase 1, human

TSL 2

Gene CLK1, Length 484 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLK1-208	ENST00000464454	TBCD	Q9BTW9	1192 aa		3.19	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	TIGAR	Q9NQ88	270 aa		3.19	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	C1orf123	Q9NWV4	160 aa		3.19	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	FAM120C	Q9NX05	1096 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	IMPAD1	Q9NX62	359 aa		3.19	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	DHRS4-AS1	Q9P1J3	65 aa		3.19	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	EIF3L	Q9Y262	564 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	NTNG1	Q9Y2I2	539 aa		3.19	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	EXOSC1	Q9Y3B2	195 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		3.19	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	CCDC7	Q96M83	1385 aa		3.19	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454		A0A087WWV3	80 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF840P	A6NDX5	716 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	LCMT2	O60294	686 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	RAMP1	O60894	148 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	OR4F21	O95013	312 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	IFNB1	P01574	187 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	CALCB	P10092	127 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	BCL3	P20749	454 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	PTMS	P20962	102 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	TRPC1	P48995	793 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	POU3F4	P49335	361 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	TFDP1	Q14186	410 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	TRIP10	Q15642	601 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	UBE2V2	Q15819	145 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	EIPR1	Q53HC9	387 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	NIPAL3	Q6P499	406 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	CENPU	Q71F23	418 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	ERAS	Q7Z444	233 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	STKLD1	Q8NE28	680 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	TFB1M	Q8WVM0	346 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	ADIPOR1	Q96A54	375 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	C11orf24	Q96F05	449 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	HPDL	Q96IR7	371 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	VPS35	Q96QK1	796 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	GPA33	Q99795	319 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	COQ10B	Q9H8M1	238 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	3.18	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	RNF6	Q9Y252	685 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	MFHAS1	Q9Y4C4	1052 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	AP4B1	Q9Y6B7	739 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	HCFC1	P51610	2035 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	RALGAPA1	Q6GYQ0	2036 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454		A0A1B0GUL7	405 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	SAP18	O00422	153 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	CASK	O14936	926 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	TM9SF1	O15321	606 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	PPIH	O43447	177 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	LANCL1	O43813	399 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF253	O75346	499 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	RHBDL1	O75783	438 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	GUCA1C	O95843	209 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	KRT6B	P04259	564 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	IGFBP1	P08833	259 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	IGFBP5	P24593	272 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	KRT6C	P48668	564 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	ARHGDIB	P52566	201 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	SLX4IP	Q5VYV7	408 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	SLC39A4	Q6P5W5	647 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	SERINC5	Q86VE9	423 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF573	Q86YE8	665 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	HPS6	Q86YV9	775 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	CENPL	Q8N0S6	344 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	MRPL13	Q9BYD1	178 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	WDR76	Q9H967	626 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	RDH8	Q9NYR8	311 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	PRODH2	Q9UF12	536 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	AP1M2	Q9Y6Q5	423 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	LRRC30	A6NM36	301 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	EFCAB7	A8K855	629 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454		G3V3Y1	287 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	NDC80	O14777	642 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	PEX11A	O75192	247 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	MFN2	O95140	757 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	GJB5	O95377	273 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	ANP32D	O95626	131 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CLK1-208	ENST00000464454	SDC1	P18827	310 aa		3.16	□□□□□ -1.9

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