RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441222.7

USP46-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP46, Length 7,954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-201ENST00000441222 A0A1W2PPV4 95 aa6.35□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 A0A1W2PS29 197 aa6.35□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 CDHR4A6H8M9 788 aa6.35□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa6.35□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 TMEM233B4DJY2 109 aa6.35□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 LAMTOR5O43504 91 aa6.35□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 SLC22A5O76082 557 aa6.35□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 TOXO94900 526 aa6.35□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 TP53P04637 393 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 UGT2B7P16662 529 aa6.35□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 JUNDP17535 347 aa6.35□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 ACY1Q03154 408 aa6.35□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 TECRLQ5HYJ1 363 aa6.35□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 CREB3L2Q70SY1 520 aa6.35□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa6.35□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 OR9I1Q8NGQ6 314 aa6.35□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 DCUN1D4Q92564 292 aa6.35□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 HAO2Q9NYQ3 351 aa6.35□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 DNAJB11Q9UBS4 358 aa6.35□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 PLAGL1Q9UM63 463 aa6.35□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 TRPM6Q9BX84 2022 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 PENKP01210 267 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 AKAIN1P0CW23 69 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 HLCSP50747 726 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 RAB5CP51148 216 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 TAP2Q03519 686 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 PRKCZQ05513 592 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 RUNX2Q13950 521 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 LEG1Q6P5S2 330 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 CFAP77Q6ZQR2 320 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 CMIPQ8IY22 773 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 IQCF1Q8N6M8 205 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 DIO2Q92813 273 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 ITFG2Q969R8 447 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 MS4A4EQ96PG1 132 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 SAMD10Q9BYL1 202 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 SALL4Q9UJQ4 1053 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 FAM227AF5H4B4 570 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 SLC1A7O00341 560 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 NDUFB2O95178 105 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 GAAP10253 952 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 CKMT1AP12532 417 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 KITLGP21583 273 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 ELK4P28324 431 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 CAV2P51636 162 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 ARHGAP1Q07960 439 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 PKDCCQ504Y2 493 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 TLDC1Q6P9B6 456 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 TMEM107Q6UX40 140 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 NAPRTQ6XQN6 538 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 TMEM151BQ8IW70 566 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 STEAP2Q8NFT2 490 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 COQ10AQ96MF6 247 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 INPP5EQ9NRR6 644 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 SACM1LQ9NTJ5 587 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 MON2Q7Z3U7 1717 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 A0A1W2PPE2 198 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 A0A1W2PR64 198 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 A0A1W2PRV1 198 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 C12orf71A8MTZ7 269 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 MAS1P04201 325 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 SERPINA5P05154 406 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 TSFMP43897 325 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 KCNQ1P51787 676 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 ARHGAP19Q14CB8 494 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 ECHDC3Q96DC8 303 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 SLC2A13Q96QE2 648 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 ZNF160Q9HCG1 818 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 SPHK2Q9NRA0 654 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 RHCGQ9UBD6 479 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 B4GALT6Q9UBX8 382 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 MST1RQ04912 1400 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 CD300LBA8K4G0 201 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 A8MVM7 634 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 B4DXG7 233 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 RFPL3O75679 317 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 CPNE6O95741 557 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 TGM6O95932 706 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 TFP02787 698 aa6.34□□□□□ -1.39
USP46-201ENST00000441222 OSMP13725 252 aa6.34□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47 ms