RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428858.1

TTC28-AS1-209, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene TTC28-AS1, Length 565 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FAM192AQ9GZU8 254 aa7.52□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RAD21L1Q9H4I0 556 aa7.52□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HPF1Q9NWY4 346 aa7.52□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ANKRD10Q9NXR5 420 aa7.52□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PLA2G3Q9NZ20 509 aa7.52□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LRFN1Q9P244 771 aa7.52□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CORO2BQ9UQ03 480 aa7.52□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OR10H1Q9Y4A9 318 aa7.52□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa7.52□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CACNA1GO43497 2377 aa7.52□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa7.51□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GXYLT2A0PJZ3 443 aa7.51□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HMGN4O00479 90 aa7.51□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TSPAN2O60636 221 aa7.51□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SLC25A12O75746 678 aa7.51□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KCNK2O95069 426 aa7.51□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 IL33O95760 270 aa7.51□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C1QCP02747 245 aa7.51□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 BMP2P12643 396 aa7.51□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MATN1P21941 496 aa7.51□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CD97P48960 835 aa7.51□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PNLIPRP2P54317 469 aa7.51□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 EFR3AQ14156 821 aa7.51□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RGNQ15493 299 aa7.51□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DECR1Q16698 335 aa7.51□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 COX20Q5RI15 118 aa7.51□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DCST2Q5T1A1 773 aa7.51□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP7.51□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SPINK14Q6IE38 97 aa7.51□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TMEM81Q6P7N7 255 aa7.51□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa7.51□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 IL20RBQ6UXL0 311 aa7.51□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HACD2Q6Y1H2 254 aa7.51□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NUP54Q7Z3B4 507 aa7.51□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa7.51□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 BCORP1Q8N888 145 aa7.51□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 COX18Q8N8Q8 333 aa7.51□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CATSPER1Q8NEC5 780 aa7.51□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OR5D16Q8NGK9 328 aa7.51□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FBXO30Q8TB52 745 aa7.51□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SPPL2AQ8TCT8 520 aa7.51□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PAQR8Q8TEZ7 354 aa7.51□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PIK3R3Q92569 461 aa7.51□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CDS1Q92903 461 aa7.51□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NTNG2Q96CW9 530 aa7.51□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RCN3Q96D15 328 aa7.51□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 COL21A1Q96P44 957 aa7.51□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa7.51□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SH3GL1Q99961 368 aa7.51□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 G6PC3Q9BUM1 346 aa7.51□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 BTBD2Q9BX70 525 aa7.51□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OR51I1Q9H343 314 aa7.51□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 EFCAB1Q9HAE3 211 aa7.51□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 POLE3Q9NRF9 147 aa7.51□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 EXD2Q9NVH0 621 aa7.51□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GID8Q9NWU2 228 aa7.51□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TAGLN3Q9UI15 199 aa7.51□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LIPT1Q9Y234 373 aa7.51□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa7.51□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CSAG2Q9Y5P2 127 aa7.51□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KCNE3Q9Y6H6 103 aa7.51□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa7.5□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ANKRD65E5RJM6 399 aa7.5□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TP53I11O14683 189 aa7.5□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NME2P1O60361 137 aa7.5□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 UGT2B11O75310 529 aa7.5□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TNFRSF21O75509 655 aa7.5□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 REM1O75628 298 aa7.5□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ATP6V1G2O95670 118 aa7.5□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 F10P00742 488 aa7.5□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 IGKV1D-16P01601 117 aa7.5□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SP1P08047 785 aa7.5□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NGFRP08138 427 aa7.5□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TFPTP0C1Z6 253 aa7.5□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OR12D1P0DN82 309 aa7.5□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ETFAP13804 333 aa7.5□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CD46P15529 392 aa7.5□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NME2P22392 152 aa7.5□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SLC6A2P23975 617 aa7.5□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 IL12BP29460 328 aa7.5□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KRT20P35900 424 aa7.5□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CRATP43155 626 aa7.5□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CASP9P55211 416 aa7.5□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FBXW4P57775 412 aa7.5□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RPP38P78345 283 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FUT5Q11128 374 aa7.5□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms