RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409006.3

KDELR3-202, Transcript of KDEL endoplasmic reticulum protein retention receptor 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene KDELR3, Length 931 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3-202ENST00000409006 NPIPB8E9PQR5 432 aa20.38■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 SLC28A1O00337 649 aa20.38■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 ZNF708P17019 499 aa20.38■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 DGKQP52824 942 aa20.38■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 PSPHP78330 225 aa20.38■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 CYP27C1Q4G0S4 372 aa20.38■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 FLYWCH1Q4VC44 716 aa20.38■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 FADS6Q8N9I5 356 aa20.38■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 FCRL1Q96LA6 429 aa20.38■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 RASSF1Q9NS23 344 aa20.38■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 C1orf109Q9NX04 203 aa20.38■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 MED11Q9P086 117 aa20.38■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa20.38■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 CLCF1Q9UBD9 225 aa20.38■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 GXYLT2A0PJZ3 443 aa20.37■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 TMEM233B4DJY2 109 aa20.37■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa20.37■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 TRIM13O60858 407 aa20.37■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 SLITRK5O94991 958 aa20.37■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 RCBTB2O95199 551 aa20.37■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 IL18BPO95998 194 aa20.37■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 CHRNGP07510 517 aa20.37■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 LINC00032P0C843 101 aa20.37■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 SDC1P18827 310 aa20.37■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 OPRM1P35372 400 aa20.37■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 IST1P53990 364 aa20.37■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 HSPB3Q12988 150 aa20.37■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 BANPQ8N9N5 519 aa20.37■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 OR2M3Q8NG83 312 aa20.37■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 OR4K17Q8NGC6 315 aa20.37■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 LINC01560Q8TB33 94 aa20.37■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 UCN2Q96RP3 112 aa20.37■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa20.37■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa20.37■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 A6NNC1 897 aa20.36■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 RGS14O43566 566 aa20.36■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 AKAP10O43572 662 aa20.36■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 TGM6O95932 706 aa20.36■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 IGKV1D-16P01601 117 aa20.36■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 CHMP24386 653 aa20.36■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 ALDH3A1P30838 453 aa20.36■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 PEX19P40855 299 aa20.36■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 RFX3P48380 749 aa20.36■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 ART1P52961 327 aa20.36■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 STX5Q13190 355 aa20.36■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 KANK2Q63ZY3 851 aa20.36■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 AAGABQ6PD74 315 aa20.36■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 GCNT2Q8N0V5 402 aa20.36■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 CLHC1Q8NHS4 586 aa20.36■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 FAM222BQ8WU58 562 aa20.36■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 LRRC46Q96FV0 321 aa20.36■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 APOPT1Q96IL0 206 aa20.36■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 TSSK3Q96PN8 268 aa20.36■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 MECRQ9BV79 373 aa20.36■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 SLC17A7Q9P2U7 560 aa20.36■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 PDPK1O15530 556 aa20.35■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 IL33O95760 270 aa20.35■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 GABRA3P34903 492 aa20.35■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 CLDN15P56746 228 aa20.35■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 RPL38P63173 70 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 DECR1Q16698 335 aa20.35■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 UGT3A2Q3SY77 523 aa20.35■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 APOOLQ6UXV4 268 aa20.35■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 RNF165Q6ZSG1 346 aa20.35■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 MARCH3Q86UD3 253 aa20.35■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 TRABD2AQ86V40 505 aa20.35■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 OR5M1Q8NGP8 315 aa20.35■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP20.35■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 PIK3R3Q92569 461 aa20.35■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 WNT2BQ93097 391 aa20.35■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 FAM111AQ96PZ2 611 aa20.35■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 TM9SF2Q99805 663 aa20.35■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 CCT7Q99832 543 aa20.35■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 REEP4Q9H6H4 257 aa20.35■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 Q9N2J8 555 aa20.35■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 EQTNQ9NQ60 294 aa20.35■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 MKS1Q9NXB0 559 aa20.35■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 MID2Q9UJV3 735 aa20.35■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 ABCA4P78363 2273 aa20.35■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 TUBAL3A6NHL2 446 aa20.34■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 LSM1O15116 133 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 SPAG7O75391 227 aa20.34■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 MAP3K8P41279 467 aa20.34■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 VSNL1P62760 191 aa20.34■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 LUZP2Q86TE4 346 aa20.34■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 EXOC3L1Q86VI1 746 aa20.34■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 CDC20BQ86Y33 519 aa20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms