RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354631.7

TRDMT1-202, Transcript of tRNA aspartic acid methyltransferase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TRDMT1, Length 8,230 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1-202ENST00000354631 SPRED1Q7Z699 444 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 VRK2Q86Y07 508 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 CMIPQ8IY22 773 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 SLC35F3Q8IY50 421 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 OR6K6Q8NGW6 343 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 UFD1Q92890 307 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 NODALQ96S42 347 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 PLD2O14939 933 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 FGF17O60258 216 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 PFDN1O60925 122 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 IDUAP35475 653 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 CDH11P55287 796 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 MFSD13AQ14CX5 517 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 MICAQ29983 383 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 ARMCX4Q5H9R4 360 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 ALKBH2Q6NS38 261 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 MISPQ8IVT2 679 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 MEIOBQ8N635 442 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 OR2T33Q8NG76 320 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 C16orf58Q96GQ5 468 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 FBXL20Q96IG2 436 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 COPS4Q9BT78 406 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 A0A1W2PPL8 197 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 FAM227AF5H4B4 570 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 ASNA1O43681 348 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 TMPRSS11DO60235 418 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 CCDC159P0C7I6 412 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 BMP2P12643 396 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 KCNJ5P48544 419 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 MS4A2Q01362 244 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 WBP2NLQ6ICG8 309 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 UBE2J2Q8N2K1 259 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 MORN4Q8NDC4 146 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 AP3S1Q92572 193 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 ITPAQ9BY32 194 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 UBQLN4Q9NRR5 601 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 TNFRSF10AO00220 468 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 ZNF195O14628 629 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 SEC14L5O43304 696 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 TNFSF14O43557 240 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 OR5F1O95221 314 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 ZNF385BQ569K4 471 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 FRMPD2BQ6IN97 320 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 ADNP2Q6IQ32 1131 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 TMEM64Q6YI46 380 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 LAPTM4BQ86VI4 370 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 UEVLDQ8IX04 471 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 OR4K5Q8NGD3 323 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 MPP4Q96JB8 637 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 ORAI3Q9BRQ5 295 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 RLFQ13129 1914 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 A0A1W2PR48 441 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 SHISA7A6NL88 538 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 WASHC1A8K0Z3 465 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 H3BNX3 289 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 IL33O95760 270 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 SOD1P00441 154 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 SERPINA3P01011 423 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 BMP1P13497 986 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 CD46P15529 392 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 CBLP22681 906 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 CD47Q08722 323 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 POU4F2Q12837 409 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 SLC27A4Q6P1M0 643 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 ZNF836Q6ZNA1 936 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 FRRS1Q6ZNA5 592 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 ATCAYQ86WG3 371 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 LINC01555Q8NAE3 123 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 OR4C15Q8NGM1 316 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 SLC2A12Q8TD20 617 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 TMEM80Q96HE8 168 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 SFXN2Q96NB2 322 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDMT1-202ENST00000354631 IL4I1Q96RQ9 567 aa3.95□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48 ms