RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 STX16O14662 325 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 CXCL13O43927 109 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 CBFA2T3O75081 653 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 STX11O75558 287 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 OR12D1P0DN82 309 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 FCGR2AP12318 317 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 IRF2P14316 349 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF823P16415 610 aa4.12□□□□□ -1.75
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PTPRC-201ENST00000348564 DLG1Q12959 904 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 UGT8Q16880 541 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF544Q6NX49 715 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 KCTD8Q6ZWB6 473 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 PRSS41Q7RTY9 318 aa4.12□□□□□ -1.75
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PTPRC-201ENST00000348564 SEPHS2Q99611 448 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
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PTPRC-201ENST00000348564 YY1AP1Q9H869 796 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 FKRPQ9H9S5 495 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 BRD7Q9NPI1 651 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 PNPOQ9NVS9 261 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 PARPBPQ9NWS1 579 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 MKS1Q9NXB0 559 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 CBLCQ9ULV8 474 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 CARD8Q9Y2G2 431 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 USH1CQ9Y6N9 552 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 TLN2Q9Y4G6 2542 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 ANKRD36A6QL64 1941 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 GYG2O15488 501 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 NME6O75414 186 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 BCHEP06276 602 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 CELA2AP08217 269 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 RAB40ALP0C0E4 278 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 SLC35E2P0CK97 266 aa4.12□□□□□ -1.75
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PTPRC-201ENST00000348564 IDO1P14902 403 aa4.12□□□□□ -1.75
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PTPRC-201ENST00000348564 ZNF84P51523 738 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 LIM2P55344 173 aa4.12□□□□□ -1.75
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PTPRC-201ENST00000348564 TNFRSF17Q02223 184 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
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PTPRC-201ENST00000348564 EIPR1Q53HC9 387 aa4.12□□□□□ -1.75
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PTPRC-201ENST00000348564 CCNJQ5T5M9 372 aa4.12□□□□□ -1.75
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PTPRC-201ENST00000348564 RNF148Q8N7C7 305 aa4.12□□□□□ -1.75
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PTPRC-201ENST00000348564 OR52E4Q8NGH9 312 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 C16orf78Q8WTQ4 265 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 OSTF1Q92882 214 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 CMTM5Q96DZ9 223 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 CCT7Q99832 543 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
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PTPRC-201ENST00000348564 P2RY12Q9H244 342 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 IGSF5Q9NSI5 407 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 NDE1Q9NXR1 346 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 P2RX2Q9UBL9 471 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 CORO2BQ9UQ03 480 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 CHD5Q8TDI0 1954 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 OR2A25A4D2G3 310 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 RNF13O43567 381 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 OR10H3O60404 316 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 NR2C1P13056 603 aa4.12□□□□□ -1.75
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PTPRC-201ENST00000348564 SLC1A3P43003 542 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 ETV4P43268 484 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 YAP1P46937 504 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 GSSP48637 474 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 HLCSP50747 726 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 HSF1Q00613 529 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 REEP5Q00765 189 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 AGERQ15109 404 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 C3AR1Q16581 482 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 ZSCAN26Q16670 478 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
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