RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327307.11

RRN3-202, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3, Length 2,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-202ENST00000327307 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 PSMG1O95456 288 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 WNT11O96014 354 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 PET100P0DJ07 73 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 CETPP11597 493 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 AMD1P17707 334 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 CFHR2P36980 270 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 RPL35P42766 123 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 MTM1Q13496 603 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 PKP1Q13835 747 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 SCARF1Q14162 830 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 RAB39AQ14964 217 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 DLG2Q15700 870 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 UGCGQ16739 394 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 MICBQ29980 383 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 PHF19Q5T6S3 580 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 MANEALQ5VSG8 457 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 SLC22A10Q63ZE4 541 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 CBLN3Q6UW01 205 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 DEF8Q6ZN54 512 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 C1orf87Q8N0U7 546 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 PQLC1Q8N2U9 271 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 PLA2G15Q8NCC3 412 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 C16orf78Q8WTQ4 265 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 LHX4Q969G2 390 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 PIGTQ969N2 578 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 SLC35C1Q96A29 364 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 TCTN2Q96GX1 697 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 FOPNLQ96NB1 174 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 CCDC3Q9BQI4 270 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 SLC35A5Q9BS91 424 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 SLC46A2Q9BY10 475 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 SLC38A7Q9NVC3 462 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 IL17BQ9UHF5 180 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 SLC23A1Q9UHI7 598 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 CD207Q9UJ71 328 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 ZDHHC9Q9Y397 364 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 ZNF337Q9Y3M9 751 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 CMAHPQ9Y471 501 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 RTL1A6NKG5 1358 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 A0A087WWL8 130 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 M0QYV0 167 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 TRIM24O15164 1050 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 OR10H2O60403 315 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 HUS1O60921 280 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 POP7O75817 140 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 ZWINTO95229 277 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 OCM2P0CE71 109 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 PGAM1P18669 254 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 PSMB4P28070 264 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 GRIA3P42263 894 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 FMO5P49326 533 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 CYB561P49447 251 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 GLUD2P49448 558 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 UCNP55089 124 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 MLLT10P55197 1068 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 PPIAP62937 165 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 MC2RQ01718 297 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 SEMG2Q02383 582 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 MED21Q13503 144 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 QRICH1Q2TAL8 776 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 ESCO2Q56NI9 601 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 CATSPEREQ5SY80 951 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 PMS2CLQ68D20 193 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 H3F3CQ6NXT2 135 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 ULK3Q6PHR2 472 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 EID3Q8N140 333 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 HORMAD2Q8N7B1 307 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 M1APQ8TC57 530 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 RAD54LQ92698 747 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 SERPINB11Q96P15 392 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 ACCSQ96QU6 501 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 OR14A2Q96R54 314 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 SYT11Q9BT88 431 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 ELOVL4Q9GZR5 314 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 FAM83DQ9H4H8 585 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 EPHX3Q9H6B9 360 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 CPNE5Q9HCH3 593 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 TMEM138Q9NPI0 162 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 THSD1Q9NS62 852 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 MTMR10Q9NXD2 777 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 TREM2Q9NZC2 230 aa6.5□□□□□ -1.37
RRN3-202ENST00000327307 LRWD1Q9UFC0 647 aa6.5□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms