RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323374.8

SPHK1-201, Transcript of sphingosine kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPHK1, Length 2,138 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1-201ENST00000323374 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa20.29■□□□□ 0.84
SPHK1-201ENST00000323374 DUSP22Q9NRW4 184 aa20.29■□□□□ 0.84
SPHK1-201ENST00000323374 AGAP5A6NIR3 686 aa20.28■□□□□ 0.84
SPHK1-201ENST00000323374 MBTPS2O43462 519 aa20.28■□□□□ 0.84
SPHK1-201ENST00000323374 THBS1P07996 1170 aa20.28■□□□□ 0.84
SPHK1-201ENST00000323374 ST6GAL1P15907 406 aa20.28■□□□□ 0.84
SPHK1-201ENST00000323374 GPR68Q15743 365 aa20.28■□□□□ 0.84
SPHK1-201ENST00000323374 SNAPC1Q16533 368 aa20.28■□□□□ 0.84
SPHK1-201ENST00000323374 TSTQ16762 297 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
SPHK1-201ENST00000323374 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa20.28■□□□□ 0.84
SPHK1-201ENST00000323374 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa20.28■□□□□ 0.84
SPHK1-201ENST00000323374 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
SPHK1-201ENST00000323374 CCNJQ5T5M9 372 aa20.28■□□□□ 0.84
SPHK1-201ENST00000323374 SLC27A4Q6P1M0 643 aa20.28■□□□□ 0.84
SPHK1-201ENST00000323374 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa20.28■□□□□ 0.84
SPHK1-201ENST00000323374 SHISA5Q8N114 240 aa20.28■□□□□ 0.84
SPHK1-201ENST00000323374 SLC34A3Q8N130 599 aa20.28■□□□□ 0.84
SPHK1-201ENST00000323374 MCFD2Q8NI22 146 aa20.28■□□□□ 0.84
SPHK1-201ENST00000323374 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
SPHK1-201ENST00000323374 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
SPHK1-201ENST00000323374 SLC41A3Q96GZ6 507 aa20.28■□□□□ 0.84
SPHK1-201ENST00000323374 LRR1Q96L50 414 aa20.28■□□□□ 0.84
SPHK1-201ENST00000323374 LRRC61Q9BV99 259 aa20.28■□□□□ 0.84
SPHK1-201ENST00000323374 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa20.28■□□□□ 0.84
SPHK1-201ENST00000323374 C2orf42Q9NWW7 574 aa20.28■□□□□ 0.84
SPHK1-201ENST00000323374 SATB2Q9UPW6 733 aa20.28■□□□□ 0.84
SPHK1-201ENST00000323374 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa20.28■□□□□ 0.84
SPHK1-201ENST00000323374 DNAH14Q0VDD8 3507 aa20.28■□□□□ 0.84
SPHK1-201ENST00000323374 SGK494L7N484 410 aa20.27■□□□□ 0.84
SPHK1-201ENST00000323374 CCRL2O00421 344 aa20.27■□□□□ 0.84
SPHK1-201ENST00000323374 MAGEB3O15480 346 aa20.27■□□□□ 0.84
SPHK1-201ENST00000323374 STX11O75558 287 aa20.27■□□□□ 0.84
SPHK1-201ENST00000323374 IFI6P09912 130 aa20.27■□□□□ 0.84
SPHK1-201ENST00000323374 OMPP47874 163 aa20.27■□□□□ 0.84
SPHK1-201ENST00000323374 RAB38P57729 211 aa20.27■□□□□ 0.84
SPHK1-201ENST00000323374 EFNB1P98172 346 aa20.27■□□□□ 0.84
SPHK1-201ENST00000323374 DCST2Q5T1A1 773 aa20.27■□□□□ 0.84
SPHK1-201ENST00000323374 RNLSQ5VYX0 342 aa20.27■□□□□ 0.84
SPHK1-201ENST00000323374 GDF7Q7Z4P5 450 aa20.27■□□□□ 0.84
SPHK1-201ENST00000323374 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
SPHK1-201ENST00000323374 NKAIN4Q8IVV8 208 aa20.27■□□□□ 0.84
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF619Q8N2I2 560 aa20.27■□□□□ 0.84
SPHK1-201ENST00000323374 RLN3Q8WXF3 142 aa20.27■□□□□ 0.84
SPHK1-201ENST00000323374 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
SPHK1-201ENST00000323374 STACQ99469 402 aa20.27■□□□□ 0.84
SPHK1-201ENST00000323374 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
SPHK1-201ENST00000323374 FAM60AQ9NP50 221 aa20.27■□□□□ 0.84
SPHK1-201ENST00000323374 MAT2BQ9NZL9 334 aa20.27■□□□□ 0.84
SPHK1-201ENST00000323374 CNIH4Q9P003 139 aa20.27■□□□□ 0.84
SPHK1-201ENST00000323374 NTNG1Q9Y2I2 539 aa20.27■□□□□ 0.84
SPHK1-201ENST00000323374 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa20.27■□□□□ 0.84
SPHK1-201ENST00000323374 HCRTR1O43613 425 aa20.27■□□□□ 0.84
SPHK1-201ENST00000323374 CDH3P22223 829 aa20.27■□□□□ 0.84
SPHK1-201ENST00000323374 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
SPHK1-201ENST00000323374 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF404Q494X3 552 aa20.27■□□□□ 0.84
SPHK1-201ENST00000323374 SYT14P1Q58G82 188 aa20.27■□□□□ 0.84
SPHK1-201ENST00000323374 C19orf48Q6RUI8 117 aa20.27■□□□□ 0.84
SPHK1-201ENST00000323374 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa20.27■□□□□ 0.84
SPHK1-201ENST00000323374 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa20.27■□□□□ 0.84
SPHK1-201ENST00000323374 MND1Q9BWT6 205 aa20.27■□□□□ 0.84
SPHK1-201ENST00000323374 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
SPHK1-201ENST00000323374 SAP130Q9H0E3 1048 aa20.27■□□□□ 0.84
SPHK1-201ENST00000323374 RACGAP1Q9H0H5 632 aa20.27■□□□□ 0.84
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF217O75362 1048 aa20.26■□□□□ 0.83
SPHK1-201ENST00000323374 DBIP07108 87 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
SPHK1-201ENST00000323374 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
SPHK1-201ENST00000323374 LIMK1P53667 647 aa20.26■□□□□ 0.83
SPHK1-201ENST00000323374 INAQ16352 499 aa20.26■□□□□ 0.83
SPHK1-201ENST00000323374 RGS21Q2M5E4 152 aa20.26■□□□□ 0.83
SPHK1-201ENST00000323374 DEFB110Q30KQ9 67 aa20.26■□□□□ 0.83
SPHK1-201ENST00000323374 MFSD4AQ8N468 514 aa20.26■□□□□ 0.83
SPHK1-201ENST00000323374 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
SPHK1-201ENST00000323374 AMER2Q8N7J2 671 aa20.26■□□□□ 0.83
SPHK1-201ENST00000323374 COX18Q8N8Q8 333 aa20.26■□□□□ 0.83
SPHK1-201ENST00000323374 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
SPHK1-201ENST00000323374 MMP27Q9H306 513 aa20.26■□□□□ 0.83
SPHK1-201ENST00000323374 DSN1Q9H410 356 aa20.26■□□□□ 0.83
SPHK1-201ENST00000323374 FAIMQ9NVQ4 179 aa20.26■□□□□ 0.83
SPHK1-201ENST00000323374 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
SPHK1-201ENST00000323374 EYSQ5T1H1 3165 aa20.26■□□□□ 0.83
SPHK1-201ENST00000323374 ARHGAP33O14559 1287 aa20.26■□□□□ 0.83
SPHK1-201ENST00000323374 RDH16O75452 317 aa20.26■□□□□ 0.83
SPHK1-201ENST00000323374 THY1P04216 161 aa20.26■□□□□ 0.83
SPHK1-201ENST00000323374 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
SPHK1-201ENST00000323374 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP20.26■□□□□ 0.83
SPHK1-201ENST00000323374 MGAT2Q10469 447 aa20.26■□□□□ 0.83
SPHK1-201ENST00000323374 DCDC5Q6ZRR9 648 aa20.26■□□□□ 0.83
SPHK1-201ENST00000323374 BTLAQ7Z6A9 289 aa20.26■□□□□ 0.83
SPHK1-201ENST00000323374 MRGPREQ86SM8 312 aa20.26■□□□□ 0.83
SPHK1-201ENST00000323374 PIK3R3Q92569 461 aa20.26■□□□□ 0.83
SPHK1-201ENST00000323374 FGF11Q92914 225 aa20.26■□□□□ 0.83
SPHK1-201ENST00000323374 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
SPHK1-201ENST00000323374 SLC38A2Q96QD8 506 aa20.26■□□□□ 0.83
SPHK1-201ENST00000323374 CENPOQ9BU64 300 aa20.26■□□□□ 0.83
SPHK1-201ENST00000323374 PRRG3Q9BZD7 231 aa20.26■□□□□ 0.83
SPHK1-201ENST00000323374 TPSD1Q9BZJ3 242 aa20.26■□□□□ 0.83
SPHK1-201ENST00000323374 LMAN1LQ9HAT1 526 aa20.26■□□□□ 0.83
SPHK1-201ENST00000323374 TBCCD1Q9NVR7 557 aa20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms