RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317907.8

TTC27-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 27, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC27, Length 2,876 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC27-201ENST00000317907 HSPB3Q12988 150 aa10.02□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 KCNC3Q14003 757 aa10.02□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 GALEQ14376 348 aa10.02□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 KRT33BQ14525 404 aa10.02□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 DCST1Q5T197 706 aa10.02□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa10.02□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 CEACAM20Q6UY09 585 aa10.02□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa10.02□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 LUZP2Q86TE4 346 aa10.02□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 UFD1Q92890 307 aa10.02□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 PPCDCQ96CD2 204 aa10.02□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 FCRL4Q96PJ5 515 aa10.02□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 AIFM2Q9BRQ8 373 aa10.02□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 PIGUQ9H490 435 aa10.02□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa10.02□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 MIEF1Q9NQG6 463 aa10.02□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 NUDT15Q9NV35 164 aa10.02□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 ANGPT4Q9Y264 503 aa10.02□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 RWDD3Q9Y3V2 267 aa10.02□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 C2orf16Q68DN1 1984 aa10.02□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 SEC16AO15027 2179 aa10.02□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 LINC00862A6NCI5 91 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 ANKDD1BA6NHY2 528 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 A8MVJ9 347 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 CHP2O43745 196 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 PRKYO43930 277 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 ADAP00813 363 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 CPEP16870 476 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 LIM2P55344 173 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 RAB14P61106 215 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 ZNF763Q0D2J5 394 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 SNTA1Q13424 505 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 SEC23BQ15437 767 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 ZNF750Q32MQ0 723 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 AGBL4Q5VU57 503 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 UNC5DQ6UXZ4 953 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 CEP76Q8TAP6 659 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 RAD51AP1Q96B01 352 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 C5orf58C9J3I9 102 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 RAF1P04049 648 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 RB1P06400 928 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 STOMP27105 288 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 MVDP53602 400 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 PRKAG1P54619 331 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 INSL4Q14641 139 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 DUSP6Q16828 381 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 PLK5Q496M5 336 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 SHISA5Q8N114 240 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 LINC01555Q8NAE3 123 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 OR52N2Q8NGI0 321 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 NEIL3Q8TAT5 605 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 TMEM163Q8TC26 289 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 OTULINQ96BN8 352 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 YIPF4Q9BSR8 244 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 ABCG5Q9H222 651 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 REEP4Q9H6H4 257 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 EXTL2Q9UBQ6 330 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 CDH10Q9Y6N8 788 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa10□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 A0A1W2PS29 197 aa10□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 PLPP1O14494 284 aa10□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 FFAR1O14842 300 aa10□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 UGDHO60701 494 aa10□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 TOXO94900 526 aa10□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 DHFRP00374 187 aa10□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 PAHP00439 452 aa10□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 SYPP08247 313 aa10□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 FAM157BP0CG42 384 aa10□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 NAGAP17050 411 aa10□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 LIMS1P48059 325 aa10□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 ADAM15Q13444 863 aa10□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 MFSD13AQ14CX5 517 aa10□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 IRF4Q15306 451 aa10□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 CHMP1BQ7LBR1 199 aa10□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa10□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 LHFPL3Q86UP9 236 aa10□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 LRRTM4Q86VH4 590 aa10□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 C17orf64Q86WR6 236 aa10□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 MARCH9Q86YJ5 346 aa10□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 OR4N4Q8N0Y3 316 aa10□□□□□ -0.81
TTC27-201ENST00000317907 OXR1Q8N573 874 aa10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 96.7 ms