RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000290317.9

SLC13A3-202, Transcript of solute carrier family 13 member 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SLC13A3, Length 3,994 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A3-202ENST00000290317 PGDP52209 483 aa7.25□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP7.25□□□□□ -1.255e-15■□□□□ 11.1
SLC13A3-202ENST00000290317 CSNK2BP67870 215 aa7.25□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 ABHD18Q0P651 414 aa7.25□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 IL18R1Q13478 541 aa7.25□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 DSG2Q14126 1118 aa7.25□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 CTF1Q16619 201 aa7.25□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 RABL3Q5HYI8 236 aa7.25□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 PAGE3Q5JUK9 113 aa7.25□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 MANEAQ5SRI9 462 aa7.25□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 DPP10Q8N608 796 aa7.25□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 C11orf65Q8NCR3 313 aa7.25□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 OR5P2Q8WZ92 322 aa7.25□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 TCTN2Q96GX1 697 aa7.25□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 CD180Q99467 661 aa7.25□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 NIPAL2Q9H841 368 aa7.25□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 TPT1P8Q9HAU6 139 aa7.25□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 ANGPT4Q9Y264 503 aa7.25□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 SPAG17Q6Q759 2223 aa7.25□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 MYLKQ15746 1914 aa7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 FADS2O95864 444 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 CAPNS1P04632 268 aa7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 PVRP15151 417 aa7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 UGT2B10P36537 528 aa7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 GZMKP49863 264 aa7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 SCN1BQ07699 218 aa7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 ATP6AP1Q15904 470 aa7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 MEP1AQ16819 746 aa7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 NRROSQ86YC3 692 aa7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 STX19Q8N4C7 294 aa7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 ACOT4Q8N9L9 421 aa7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 RADILQ96JH8 1075 aa7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 SLC35A5Q9BS91 424 aa7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 NDC1Q9BTX1 674 aa7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 MMP28Q9H239 520 aa7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 ZNF385DQ9H6B1 395 aa7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 ZSCAN32Q9NX65 697 aa7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 ERVK13-1Q9NX77 482 aa7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 MALT1Q9UDY8 824 aa7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 FBXO4Q9UKT5 387 aa7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 GPR179Q6PRD1 2367 aa7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 LILRA5A6NI73 299 aa7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 AQP12BA6NM10 295 aa7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 GABRR3A8MPY1 467 aa7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 C6orf47O95873 294 aa7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 MT-ND1P03886 318 aa7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 CRHBPP24387 322 aa7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 HOXA6P31267 233 aa7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 BCL6P41182 706 aa7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 TSFMP43897 325 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 RPS5P46782 204 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 EPS8Q12929 822 aa7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 C4orf46Q504U0 113 aa7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 CYBRD1Q53TN4 286 aa7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 C6orf141Q5SZD1 244 aa7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 XAF1Q6GPH4 301 aa7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 AQP12AQ8IXF9 295 aa7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 SLC37A3Q8NCC5 494 aa7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 OR8J2Q8NGG1 315 aa7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 TMEM74Q96NL1 305 aa7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 SERINC2Q96SA4 455 aa7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 DPYSL5Q9BPU6 564 aa7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 PDCD10Q9BUL8 212 aa7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 BTNL2Q9UIR0 455 aa7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 SNX11Q9Y5W9 270 aa7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 LRIT2A6NDA9 550 aa7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 H0YGG7 62 aa7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 SLC30A4O14863 429 aa7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 EML2O95834 649 aa7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 ADORA3P0DMS8 318 aa7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 ERGP11308 486 aa7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 GCNT6Q5T4J0 391 aa7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 CHMP1BQ7LBR1 199 aa7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 RASGRP3Q8IV61 690 aa7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 FBXO30Q8TB52 745 aa7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 NANPQ8TBE9 248 aa7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 TEX37Q96LM6 180 aa7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 UBQLN2Q9UHD9 624 aa7.24□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.9 ms