RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000277657.12

CCDC7-201, Transcript of coiled-coil domain containing 7, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC7, Length 1,899 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7-201ENST00000277657 SRPK3Q9UPE1 567 aa20.51■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 A0A0C4DFX4 3053 aa20.51■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 WDFY4Q6ZS81 3184 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 FAAHO00519 579 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 KCNK2O95069 426 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 IFNA16P05015 189 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 CDH15P55291 814 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 RPP38P78345 283 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 ANGPT1Q15389 498 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 LPAL2Q16609 132 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 LIN52Q52LA3 116 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 C6orf141Q5SZD1 244 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 FOXB2Q5VYV0 432 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 PARP8Q8N3A8 854 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 ZNF615Q8N8J6 731 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 AQP11Q8NBQ7 271 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 RCBTB1Q8NDN9 531 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 SLC7A13Q8TCU3 470 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 NR4A3Q92570 626 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 HRASLS5Q96KN8 279 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 FNDC11Q9BVV2 318 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 FAM192AQ9GZU8 254 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 ZNF556Q9HAH1 456 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 ERVK-19Q9WJR5 959 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 GMPPBQ9Y5P6 360 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 FER1L5A0AVI2 2057 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 A0A087WXM4 84 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 TPST2O60704 377 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 GASTP01350 101 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 DBIP07108 87 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 IL7RP16871 459 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 NR1H2P55055 460 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 MAPK14Q16539 360 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 MEP1AQ16819 746 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 LAIR2Q6ISS4 152 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 RHBDD2Q6NTF9 364 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 ZNF836Q6ZNA1 936 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 CCDC74BQ96LY2 380 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 CNPPD1Q9BV87 410 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 KCNE5Q9UJ90 142 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 DTX4Q9Y2E6 619 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 SH3PXD2BA1X283 911 aa20.49■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 CLPSP04118 112 aa20.49■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 AVPR2P30518 371 aa20.49■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 PGDP52209 483 aa20.49■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 RHAGQ02094 409 aa20.49■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 EIPR1Q53HC9 387 aa20.49■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 C1orf189Q5VU69 101 aa20.49■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 FIGNL1Q6PIW4 674 aa20.49■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa20.49■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 C7orf57Q8NEG2 295 aa20.49■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 APOL4Q9BPW4 351 aa20.49■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 OR10A5Q9H207 317 aa20.49■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 FRS3O43559 492 aa20.48■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 ADAP00813 363 aa20.48■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 NID1P14543 1247 aa20.48■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 HLCSP50747 726 aa20.48■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 DAB2P98082 770 aa20.48■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 ARHGAP40Q5TG30 622 aa20.48■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 OR7G1Q8NGA0 311 aa20.48■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 C16orf52Q8NHV5 167 aa20.48■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa20.48■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 MGAT4BQ9UQ53 548 aa20.48■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 TTC36A6NLP5 189 aa20.47■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 CLDN24A6NM45 220 aa20.47■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 C17orf105B2RV13 164 aa20.47■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 CRHBPP24387 322 aa20.47■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 MPLP40238 635 aa20.47■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 EFNA3P52797 238 aa20.47■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 CDK5R2Q13319 367 aa20.47■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 NPSR1Q6W5P4 371 aa20.47■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 SATL1Q86VE3 508 aa20.47■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 DIO2Q92813 273 aa20.47■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 TSLPQ969D9 159 aa20.47■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 OR6C1Q96RD1 312 aa20.47■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 SMOC1Q9H4F8 434 aa20.47■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 ENOPH1Q9UHY7 261 aa20.47■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa20.47■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa20.47■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 PEX12O00623 359 aa20.47■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 ATXN8OSP0DMR3 200 aa20.47■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 CT45A8P0DMV1 189 aa20.47■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 CT45A9P0DMV2 189 aa20.47■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 TNNI3P19429 210 aa20.47■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 IL5RAQ01344 420 aa20.47■□□□□ 0.87
CCDC7-201ENST00000277657 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms